RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C15orf54Q8N8G6 183 aa17.14■□□□□ 0.33
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCXQ7RTU7 201 aa17.13■□□□□ 0.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHCHD5Q9BSY4 110 aa17.13■□□□□ 0.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM17P0DL12 118 aa17.12■□□□□ 0.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PKIAP61925 76 aa17.12■□□□□ 0.33
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM97Q5BJF2 176 aa17.1■□□□□ 0.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DERL1Q9BUN8 251 aa17.1■□□□□ 0.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHAC1Q9BUX1 264 aa17.1■□□□□ 0.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa17.1■□□□□ 0.33
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB5CP51148 216 aa17.04■□□□□ 0.32
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa17.04■□□□□ 0.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa17.04■□□□□ 0.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa17.03■□□□□ 0.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L23D6RBM5 183 aa17.03■□□□□ 0.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX46H3BTG2 121 aa17.03■□□□□ 0.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MGPP08493 103 aa17.03■□□□□ 0.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLC6P0CF74 106 aa17.03■□□□□ 0.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAGE6Q13070 117 aa17.03■□□□□ 0.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2D3Q8NGH3 330 aa17.03■□□□□ 0.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV2-8P01709 118 aa17.02■□□□□ 0.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBX1P62877 108 aa17.02■□□□□ 0.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H7C1H1 209 aa17.01■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNG4P50150 75 aa17.01■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR34Q9NV39 138 aa17.01■□□□□ 0.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf71A6NCJ1 209 aa17■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0QY20 66 aa17■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CACNG7P62955 275 aa17■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCJQ1A5X6 159 aa17■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLPSL2Q6UWE3 100 aa17■□□□□ 0.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUMO4Q6EEV6 95 aa16.99■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XKRY2A2RUG3 117 aa16.98■□□□□ 0.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P01737 135 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS1P07477 247 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SULT1A2P50226 295 aa16.97■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F2Z2F3 143 aa16.96■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFNA1P01562 189 aa16.96■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa16.96■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED9Q9NWA0 146 aa16.96■□□□□ 0.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa16.95■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRGC1P0CF51 173 aa16.94■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASL11AQ6T310 242 aa16.94■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BIN3Q9NQY0 253 aa16.94■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa16.93■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REG3AQ06141 175 aa16.93■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LYZL1Q6UWQ5 148 aa16.93■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM243Q9BU79 118 aa16.92■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPH3P1Q9H4G8 78 aa16.92■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL2P10415 239 aa16.91■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9orf163Q8N9P6 203 aa16.91■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa16.9■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NTF3P20783 257 aa16.9■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C20orf203Q8NBC4 194 aa16.9■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NIT2Q9NQR4 276 aa16.9■□□□□ 0.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9orf62Q8N4C0 152 aa16.89■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa16.88■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GUV1 79 aa16.88■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR73Q6P4I2 378 aa16.88■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLRN3Q8NCR9 226 aa16.88■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDT10Q8NFP7 164 aa16.88■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDT11Q96G61 164 aa16.88■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGLYRP4Q96LB8 373 aa16.88■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTRLP40313 264 aa16.87■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC51BQ86UW2 128 aa16.87■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCTE3Q8IZS6 198 aa16.87■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa16.86■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2L6O14933 153 aa16.85■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
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