RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 ENHOQ6UWT2 76 aa14.75□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 ELOBQ15370 118 aa14.74□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.74□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.74□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 HERC1Q15751 4861 aa14.74□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 MYCBP2O75592 4640 aa14.73□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 IGLC6P0CF74 106 aa14.73□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 SULT1A2P50226 295 aa14.73□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 RAB5CP51148 216 aa14.73□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.73□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 Q8N976 141 aa14.73□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.72□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 Q0VG73 95 aa14.71□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 OR2D3Q8NGH3 330 aa14.71□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 AP1S3Q96PC3 154 aa14.71□□□□□ -0.05
KDELR3-202ENST00000409006 TPPP3Q9BW30 176 aa14.71□□□□□ -0.05
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KDELR3-202ENST00000409006 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.7□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.7□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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KDELR3-202ENST00000409006 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.69□□□□□ -0.06
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KDELR3-202ENST00000409006 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.68□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 TEX46H3BTG2 121 aa14.67□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 M0QY20 66 aa14.67□□□□□ -0.06
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KDELR3-202ENST00000409006 RPS20P60866 119 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 SCXQ7RTU7 201 aa14.67□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 LINC00528Q8N1L1 170 aa14.67□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 MED9Q9NWA0 146 aa14.67□□□□□ -0.06
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KDELR3-202ENST00000409006 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.66□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 PDE6DO43924 150 aa14.65□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 BCL2P10415 239 aa14.65□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 CLPSL2Q6UWE3 100 aa14.65□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 SMIM12Q96EX1 92 aa14.65□□□□□ -0.06
KDELR3-202ENST00000409006 P01737 135 aa14.64□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 RBX1P62877 108 aa14.64□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 CACNG7P62955 275 aa14.64□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.64□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 SLC51BQ86UW2 128 aa14.64□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 IFNA1P01562 189 aa14.63□□□□□ -0.07
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KDELR3-202ENST00000409006 PRR34Q9NV39 138 aa14.63□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.62□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 HLA-DQA1P01909 254 aa14.62□□□□□ -0.07
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KDELR3-202ENST00000409006 IQCJQ1A5X6 159 aa14.62□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa14.62□□□□□ -0.07
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KDELR3-202ENST00000409006 NUDT10Q8NFP7 164 aa14.62□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 NUDT11Q96G61 164 aa14.62□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 USP17L23D6RBM5 183 aa14.61□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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KDELR3-202ENST00000409006 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.61□□□□□ -0.07
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KDELR3-202ENST00000409006 H7C1H1 209 aa14.6□□□□□ -0.07
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KDELR3-202ENST00000409006 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa14.6□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.59□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 XKRY2A2RUG3 117 aa14.59□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 PRSS1P07477 247 aa14.59□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 C14orf177Q52M58 125 aa14.59□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 RASL11AQ6T310 242 aa14.59□□□□□ -0.07
KDELR3-202ENST00000409006 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.59□□□□□ -0.07
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KDELR3-202ENST00000409006 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
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KDELR3-202ENST00000409006 CTRLP40313 264 aa14.57□□□□□ -0.08
KDELR3-202ENST00000409006 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.57□□□□□ -0.08
KDELR3-202ENST00000409006 OCC1Q8TAD7 63 aa14.57□□□□□ -0.08
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KDELR3-202ENST00000409006 NIT2Q9NQR4 276 aa14.56□□□□□ -0.08
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KDELR3-202ENST00000409006 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa14.55□□□□□ -0.08
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KDELR3-202ENST00000409006 TWIST1Q15672 202 aa14.54□□□□□ -0.08
KDELR3-202ENST00000409006 WDR73Q6P4I2 378 aa14.54□□□□□ -0.08
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM243Q9BU79 118 aa14.54□□□□□ -0.08
KDELR3-202ENST00000409006 CNFNQ9BYD5 112 aa14.54□□□□□ -0.08
KDELR3-202ENST00000409006 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
KDELR3-202ENST00000409006 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-202ENST00000409006 GTSF1Q8WW33 167 aa14.53□□□□□ -0.08
KDELR3-202ENST00000409006 GATD1Q8NB37 220 aa14.52□□□□□ -0.09
KDELR3-202ENST00000409006 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.52□□□□□ -0.09
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