RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF497Q6ZNH5 498 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB126Q9BYW3 111 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2L6O14933 153 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFA3O95167 84 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 C15orf32Q32M92 178 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 C19orf73Q9NVV2 129 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 K7EQD1 137 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIAP1O43715 76 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 COPS9Q8WXC6 57 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMM21Q9BVV7 248 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNHIT1O43257 154 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZRP5 223 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZS46 218 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 CLEC2BQ92478 149 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 KLLNB2CW77 178 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-13P01766 116 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 LPAL2Q16609 132 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 C7orf69Q9H7B7 122 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 SPRR3Q9UBC9 169 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 A6NN06 94 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 P0C879 139 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR25Q96S07 402 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 GUSBP11Q6P575 273 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 BLCAPP62952 87 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 Q1RN00 199 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 ESRGQ1W209 222 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 USP24Q9UPU5 2620 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 C16orf90A8MZG2 172 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 TWIST1Q15672 202 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMG4Q5JS54 123 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 DIRC1Q969H9 104 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCA4P78363 2273 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF815PA8K554 130 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 NXPH4O95158 308 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 SYCNQ0VAF6 134 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 PATE1Q8WXA2 126 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-30P01768 117 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 KLKP1Q107X0 134 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 C12orf77C9JDV5 145 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 E7EQL1 145 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01554Q52M75 96 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM223A0PJW6 202 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 D6R8Y8 96 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf98A8MV24 154 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL13Q99616 98 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 M0R135 149 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 MP68P56378 58 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 PLGLAQ15195 96 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL4L1Q8NHW4 92 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 DYNLRB1Q9NP97 96 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 DSCAMO60469 2012 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 PRAC1Q96KF2 57 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 PATE4P0C8F1 98 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 C2orf83Q53S99 150 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF185Q96GF1 192 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0J9YY99 117 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 FDCSPQ8NFU4 85 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 B4DSR2 109 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 H0Y9J4 135 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 C6orf99Q4VX62 202 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00473A8K010 186 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 X6R8D5 127 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2BP63146 152 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms