RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375425.9

NELFE-201, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-201ENST00000375425 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.33□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 ENHOQ6UWT2 76 aa9.33□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.33□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 GZMBP10144 247 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 RAB5CP51148 216 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 MPV17L2Q567V2 206 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 C11orf52Q96A22 123 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.32□□□□□ -0.92
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NELFE-201ENST00000375425 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 CENPWQ5EE01 88 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 TPPP3Q9BW30 176 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 RAB19A4D1S5 217 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 TEX46H3BTG2 121 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 CRPP02741 224 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 Q6ZNX1 250 aa9.31□□□□□ -0.92
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NELFE-201ENST00000375425 AP1S3Q96PC3 154 aa9.31□□□□□ -0.92
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NELFE-201ENST00000375425 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 IGLC6P0CF74 106 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 GNG4P50150 75 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 SULT1A2P50226 295 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 PKIAP61925 76 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 SCXQ7RTU7 201 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 M0QY20 66 aa9.28□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 PDE6DO43924 150 aa9.28□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 MGPP08493 103 aa9.28□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 SMIM12Q96EX1 92 aa9.28□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.28□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 MED9Q9NWA0 146 aa9.28□□□□□ -0.92
NELFE-201ENST00000375425 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 P01737 135 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 RBX1P62877 108 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 CACNG7P62955 275 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 GAGE6Q13070 117 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 MIAQ16674 131 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 C14orf177Q52M58 125 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 XKRY2A2RUG3 117 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 F2Z2F3 143 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 H7C1H1 209 aa9.26□□□□□ -0.93
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NELFE-201ENST00000375425 PRR34Q9NV39 138 aa9.26□□□□□ -0.93
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NELFE-201ENST00000375425 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 SLC51BQ86UW2 128 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 BCL2P10415 239 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 NTF3P20783 257 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 BIN3Q9NQY0 253 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 J3QL48 77 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 RASL11AQ6T310 242 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 NUDT11Q96G61 164 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.23□□□□□ -0.93
NELFE-201ENST00000375425 PRSS1P07477 247 aa9.22□□□□□ -0.93
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NELFE-201ENST00000375425 WDR73Q6P4I2 378 aa9.22□□□□□ -0.93
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NELFE-201ENST00000375425 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-201ENST00000375425 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-201ENST00000375425 OCC1Q8TAD7 63 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-201ENST00000375425 TMEM243Q9BU79 118 aa9.21□□□□□ -0.94
NELFE-201ENST00000375425 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
NELFE-201ENST00000375425 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.2□□□□□ -0.94
NELFE-201ENST00000375425 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.2□□□□□ -0.94
NELFE-201ENST00000375425 A0A1B0GUV1 79 aa9.2□□□□□ -0.94
NELFE-201ENST00000375425 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
NELFE-201ENST00000375425 TWIST1Q15672 202 aa9.2□□□□□ -0.94
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
NELFE-201ENST00000375425 K7EN84 100 aa9.19□□□□□ -0.94
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