RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPDYE4A6NLX3 237 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC169A6NNP5 214 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 F8WDY8 70 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP1R2P9O14990 202 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCL2P13500 99 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCND2P30279 289 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GUCA2AQ02747 115 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MIR22HGQ0VDD5 57 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC91Q7Z6B0 441 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM24BQ8N5W8 94 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SAMD12Q8N8I0 201 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRC29Q8WV35 223 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FEZ1Q99689 392 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H2AJQ99878 128 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM43Q9BTV4 400 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FTHL17Q9BXU8 183 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A0B4J2E0 115 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GX12 115 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRBOX1C9JBD0 128 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TXNDC9O14530 226 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LSM1O15116 133 aaKnown RBP-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FABP3P05413 133 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM10L1P0DMW3 83 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COTL1Q14019 142 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EXOC3L4Q17RC7 722 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TCTE3Q8IZS6 198 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NXNL1Q96CM4 212 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM10Q96HG1 83 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IFT27Q9BW83 186 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM218A2RU14 115 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A6NIN4 97 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ENSAO43768 121 aaKnown RBP-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DDAH1O94760 285 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLTBP09497 229 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NFYBP25208 207 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GCLMP48507 274 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTPAP49638 278 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PMVKQ15126 192 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KHDC3LQ587J8 217 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CXorf40AQ8TE69 158 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DTD1Q8TEA8 209 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAPSLQ8WWF8 208 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 METTL21AQ8WXB1 218 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C20orf27Q9GZN8 174 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSME2Q9UL46 239 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNX10Q9Y5X0 201 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRXQ9BXM0 1461 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCC9O60706 1549 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UQCR11O14957 56 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CXCL3P19876 107 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLCXD3Q63HM9 321 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC35D2Q76EJ3 337 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00301Q8NCQ3 95 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HAUS1Q96CS2 278 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KXD1Q9BQD3 176 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C20orf78Q9BR46 151 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COPEO14579 308 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STK17BO94768 372 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANP32DO95626 131 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNAP29O95721 258 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NPYP01303 97 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL5P05113 134 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRGAP2BP0DMP2 458 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00694P0DN24 101 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPCS3P61009 180 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCN1P1Q5VSP4 162 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARL9Q6T311 187 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AHSA2Q719I0 299 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COMMD7Q86VX2 200 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 hADV38S2A0JD32 116 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR5H14A6NHG9 310 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H3BNH8 94 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STX6O43752 255 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DEXIO95424 95 aa-5.43□□□□□ -3.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms