RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 MDFICQ9P1T7 246 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 AGRNO00468 2067 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 IFITM10A6NMD0 228 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 PRSS47A8MTI9 375 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 FXYD7P58549 80 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 LINC00310P59036 64 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 BAGE3Q86Y29 109 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 AMN1Q8IY45 258 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 ORMDL3Q8N138 153 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 SPXQ9BT56 116 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 ZMAT4Q9H898 229 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-217ENST00000583667 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 EVI2AP22794 236 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 SYT8Q8NBV8 401 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 MRAP2Q96G30 205 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 LINC01587Q99440 93 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 CBY3A6NI87 242 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 CKS2P33552 79 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 LINC00315P59091 139 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 TMEM18Q96B42 140 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 PRELID3AQ96N28 172 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 AP1S3Q96PC3 154 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 XCL2Q9UBD3 114 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 D6R8Y8 96 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 M0R381 172 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 NUPR1O60356 82 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 SERF1AO75920 110 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 S100A2P29034 98 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 ZNF415Q09FC8 603 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 NIT1Q86X76 327 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 CSTL1Q9H114 145 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 LINC01546A6NGU7 62 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 M0R2P5 195 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 PPP1R17O96001 155 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 LINC00614P0C842 121 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 PMCHP20382 165 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 SSTP61278 116 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 IL17DQ8TAD2 202 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 CRYGDP07320 174 aa8.6□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 ZNF876PQ49A33 203 aa8.6□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 NRACQ8N912 160 aa8.6□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 RASL10AQ92737 203 aa8.6□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 KMT2AQ03164 3969 aa8.6□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 A8MWV9 139 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 A8MZ25 164 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 TNFRSF6BO95407 300 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 SMIM17P0DL12 118 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 IQCJQ1A5X6 159 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 C20orf78Q9BR46 151 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-217ENST00000583667 MUC4Q99102 2169 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 SPRY2O43597 315 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 NPYP01303 97 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 FABP4P15090 132 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 K7EMI3 77 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 CIDEAO60543 219 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 HSBP1O75506 76 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 AZU1P20160 251 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 AKR1D1P51857 326 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 APOC4P55056 127 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 C16orf74Q96GX8 76 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 HERC1Q15751 4861 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.56□□□□□ -1.04
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