RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 TTC32Q5I0X7 151 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 OCC1Q8TAD7 63 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 TEX46H3BTG2 121 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 MED9Q9NWA0 146 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 A8MWV9 139 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 M0R381 172 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 CXCL1P09341 107 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 MED14OSP0DP75 135 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 PDE6DO43924 150 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 OR5AL1P0C617 328 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 RHOHQ15669 191 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 NUDT11Q96G61 164 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 TIRAPP58753 221 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 GAGE12JA6NER3 117 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 GNG4P50150 75 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 SSTP61278 116 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 BLOC1S1P78537 153 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 GAGE1Q13065 139 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 GAGE4Q13068 117 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 GAGE5Q13069 117 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 GAGE13Q4V321 117 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TOR2AQ5JU69 321 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TEX261Q6UWH6 196 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 SYT8Q8NBV8 401 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 GTSF1Q8WW33 167 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM210AQ96ND0 272 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 KRTAP10-2P60368 255 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 SMIM12Q96EX1 92 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 FAT1Q14517 4588 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM250H0YL14 139 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 IFNA1P01562 189 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ZFP82Q8N141 532 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 RHODO00212 210 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CTRLP40313 264 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 UBE2D3P61077 147 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 UBE2D2P62837 147 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 LELP1Q5T871 98 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CNFNQ9BYD5 112 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 K7EP13 123 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 EVI2AP22794 236 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 IFITM2Q01629 132 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC01551Q86U37 167 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 M0QY20 66 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 GAS8-AS1O95177 125 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 P01737 135 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 NTF3P20783 257 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 RAB4BP61018 213 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 IGHV3-30P01768 117 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 IGHV3-33P01772 117 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 WFDC2Q14508 124 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 CEBPGP53567 150 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 NFE4Q86UQ8 179 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.44□□□□□ -1.06
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