RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556778.5

PRKCH-222, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-222	ENST00000556778	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	PRSS47	A8MTI9	375 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778		P0DMU3	169 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM231A	P0DMU4	169 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM231C	P0DMU5	169 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	PTH2	Q96A98	100 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	TPPP3	Q9BW30	176 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	PRO0255	Q9UI72	69 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PRKCH-222	ENST00000556778	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF727	A8MUV8	499 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778		K7EQD1	137 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778		P01737	135 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	CRYGD	P07320	174 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	IGLC6	P0CF74	106 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	GYPE	P15421	78 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	GTSF1	Q8WW33	167 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	SFRP2	Q96HF1	295 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778		H3BNG1	76 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	SNAI2	O43623	268 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	PEA15	Q15121	130 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	LINC01551	Q86U37	167 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	SMIM12	Q96EX1	92 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778		A8MWV9	139 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	RNF212	Q495C1	297 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	ZFP82	Q8N141	532 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	SYT8	Q8NBV8	401 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	GAGE12J	A6NER3	117 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	NXPH4	O95158	308 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	OR5AL1	P0C617	328 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	CCL18	P55774	89 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	LINC00315	P59091	139 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	ERVFC1-1	P60608	527 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	RAB14	P61106	215 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	GAGE1	Q13065	139 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	GAGE4	Q13068	117 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	GAGE5	Q13069	117 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	SLA	Q13239	276 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	GAGE13	Q4V321	117 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	CLLU1	Q5K131	121 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	CXCL1	P09341	107 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	NTF3	P20783	257 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	EVI2A	P22794	236 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	S100A1	P23297	94 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	SRI	P30626	198 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778		Q9H8V8	135 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	ADIRF	Q15847	76 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778		Q6ZR54	194 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	ISOC2	Q96AB3	205 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	CDIP1	Q9H305	208 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	BIN3	Q9NQY0	253 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	NAT8	Q9UHE5	227 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778		V9GYV3	84 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PRKCH-222	ENST00000556778	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PRKCH-222	ENST00000556778		F5H697	171 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PRKCH-222	ENST00000556778	LINC00694	P0DN24	101 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PRKCH-222	ENST00000556778	CTRL	P40313	264 aa		6.02	□□□□□ -1.45

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