RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CRYGDP07320 174 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPS20P60866 119 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-221ENST00000540665 Q6ZSN1 163 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RBFOX3A6NFN3 312 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR10AG1Q8NH19 301 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.02□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A087WWL8 130 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC00315P59091 139 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNP2Q05952 138 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.01□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 XKRY2A2RUG3 117 aa11□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 P01737 135 aa11□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGLC6P0CF74 106 aa11□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EVI2AP22794 236 aa11□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LELP1Q5T871 98 aa11□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR2D3Q8NGH3 330 aa11□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNAH11Q96DT5 4516 aa11□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa10.99□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C10orf126Q8N4M7 172 aa10.99□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GAGE12JA6NER3 117 aa10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAB4BP61018 213 aa10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GAGE1Q13065 139 aa10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GAGE4Q13068 117 aa10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GAGE5Q13069 117 aa10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GAGE13Q4V321 117 aa10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC01556Q5JQF7 62 aa10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NFE4Q86UQ8 179 aa10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM210AQ96ND0 272 aa10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AP1S3Q96PC3 154 aa10.98□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR10J3Q5JRS4 329 aa10.97□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOR2AQ5JU69 321 aa10.97□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A087WWC5 75 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 F2Z2F3 143 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 K7EN84 100 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GZMBP10144 247 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CACNG7P62955 275 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF56Q15929 161 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR10G8Q8NGN5 311 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 Q9UF83 564 aa10.96□□□□□ -0.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUDT10Q8NFP7 164 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OCC1Q8TAD7 63 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUDT11Q96G61 164 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MSRB1Q9NZV6 116 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.95□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MUC21A0A140T8X8 626 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMIM17P0DL12 118 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CTRLP40313 264 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TEX261Q6UWH6 196 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM231DQ6ZW35 169 aa10.94□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBE2D3P61077 147 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBE2D2P62837 147 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDR73Q6P4I2 378 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TPPP3Q9BW30 176 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CNFNQ9BYD5 112 aa10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIAA1109Q2LD37 5005 aa10.92□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SRP19P09132 144 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRGC1P0CF51 173 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LAGE3Q14657 143 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LYZL1Q6UWQ5 148 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMIM7Q9BQ49 75 aa10.91□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 F5H697 171 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CEBPGP53567 150 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERVFC1-1P60608 527 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SSTP61278 116 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CT83Q5H943 113 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa10.9□□□□□ -0.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HERC2O95714 4834 aa10.9□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF727A8MUV8 499 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 H7C1H1 209 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC01551Q86U37 167 aa10.89□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GATCO43716 136 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV3-30P01768 117 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV3-33P01772 117 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NTF3P20783 257 aa10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHCHD7Q9BUK0 85 aa10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.1 ms