RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529404.5

FADS3-208, Transcript of fatty acid desaturase 3, human

TSL 2

Gene FADS3, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS3-208	ENST00000529404	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	GAGE12B	A1L429	117 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	LINC01549	A6NIU2	74 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	AMTN	Q6UX39	209 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404		Q8N2B8	174 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	DUX5	Q96PT3	197 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	TM2D2	Q9BX73	214 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	CR1	P17927	2039 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404		H3BUT2	72 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	GCSH	P23434	173 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404		Q8N1Y9	231 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	VCY	O14598	125 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	GAGE10	A6NGK3	116 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	SMIM13	P0DJ93	91 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	TAL2	Q16559	108 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	CEND1	Q8N111	149 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	SYT8	Q8NBV8	401 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	CRYBA4	P53673	196 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	ACACB	O00763	2458 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	IGIP	A6NJ69	53 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	TSHB	P01222	138 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	CRYGD	P07320	174 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	RAB37	Q96AX2	223 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404		F5H697	171 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	LINC01619	G3V211	115 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404		K7EP34	96 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404		A8MTW9	85 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404		A0A1W2PPM0	123 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	OR11H12	B2RN74	326 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404		E9PLD3	99 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404		M0QY20	66 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	SAP30	O75446	220 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	OR11H1	Q8NG94	326 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	OR11H2	Q8NH07	326 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	SLURP1	P55000	103 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM141	Q96I45	108 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	TIMM17A	Q99595	171 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	USP24	Q9UPU5	2620 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404		Q96MF0	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	PMVK	Q15126	192 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	DEFB136	Q30KP8	78 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF56	Q15929	161 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	KNCN	A6PVL3	124 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	C11orf86	A6NJI1	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404		K7ERJ3	54 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	DEFB131A	P59861	70 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	RHOH	Q15669	191 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF876P	Q49A33	203 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	AGRN	O00468	2067 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FADS3-208	ENST00000529404	ZAN	Q9Y493	2812 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FADS3-208	ENST00000529404		H3BMM0	161 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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