RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF843Q8N446 348 aa13.39□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 Q9HAA7 133 aa13.39□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 PCDH15Q96QU1 1955 aa13.39□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A0J9YX75 114 aa13.39□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 C10orf142B7Z368 130 aa13.39□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 FGF6P10767 208 aa13.39□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 NDUFA11Q86Y39 141 aa13.39□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa13.38□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 C22orf34Q6ZV56 151 aa13.38□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 C9orf118A6NHY6 69 aa13.38□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF124Q15973 351 aa13.38□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 ZFP2Q6ZN57 461 aa13.38□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 SPRY2O43597 315 aa13.38□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa13.37□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 CEND1Q8N111 149 aa13.37□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 Q9H8V8 135 aa13.37□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 EDA2RQ9HAV5 297 aa13.37□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 MSRB1Q9NZV6 116 aa13.37□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 PROP1O75360 226 aa13.37□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 CRLF1O75462 422 aa13.37□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 HHLA3Q9XRX5 114 aa13.37□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 PRSS47A8MTI9 375 aa13.36□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 UBE2BP63146 152 aa13.36□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 WFDC11Q8NEX6 87 aa13.36□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 MYO18BQ8IUG5 2567 aa13.36□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 CTRLP40313 264 aa13.36□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 DEFB135Q30KP9 77 aa13.36□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 C11orf71Q6IPW1 123 aa13.36□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 EBI3Q14213 229 aa13.36□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 C5orf38Q86SI9 138 aa13.36□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 TNCP24821 2201 aa13.35□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 COX7A2LO14548 114 aa13.35□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV12-3P01733 135 aa13.35□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC140Q96MF4 163 aa13.35□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 C11orf1Q9H5F2 150 aa13.35□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 LGALS9O00182 355 aa13.35□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 RPL32P62910 135 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC01545Q5VT33 79 aa13.35□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 AMTNQ6UX39 209 aa13.34□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 CAMK2N2Q96S95 79 aa13.34□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 IFITM1P13164 125 aa13.34□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.34□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.34□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa13.33□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 WNK1Q9H4A3 2382 aa13.33□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 MAP6D1Q9H9H5 199 aa13.33□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 NAV3Q8IVL0 2385 aa13.33□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa13.33□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 UTF1Q5T230 341 aa13.33□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 UBL5Q9BZL1 73 aa13.33□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC168Q8NDH2 2452 aa13.32□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 IL17DQ8TAD2 202 aa13.32□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 GTSF1Q8WW33 167 aa13.32□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 TM2D2Q9BX73 214 aa13.32□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 ODF3Q96PU9 254 aa13.32□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa13.31□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 F8W735 103 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 PRO0255Q9UI72 69 aa13.31□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 PPDPFLQ8WWR9 84 aa13.31□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 DSCR8Q96T75 97 aa13.3□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 IGF2RP11717 2491 aa13.3□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 F8W1H4 67 aa13.3□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 MED12LQ86YW9 2145 aa13.3□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A0J9YXV3 536 aa13.3□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV3-30P01768 117 aa13.3□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV3-33P01772 117 aa13.3□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa13.3□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa13.3□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 TIMM17AQ99595 171 aa13.3□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 BRWD1-AS2P59051 145 aa13.3□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZVH6 145 aa13.29□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC01548A6NM66 108 aa13.29□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV4A0A0B4J268 109 aa13.29□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 LY6LH3BQJ8 138 aa13.29□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 DSCAMO60469 2012 aa13.29□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 CRIP3Q6Q6R5 217 aa13.28□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa13.28□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 CFC1BP0CG36 223 aa13.28□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 CFC1P0CG37 223 aa13.28□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa13.27□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 CRYGBP07316 175 aa13.27□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 ESM1Q9NQ30 184 aa13.27□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 C19orf71A6NCJ1 209 aa13.27□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZPA2 131 aa13.27□□□□□ -0.28
PTDSS1-202ENST00000517309 C12orf74Q32Q52 190 aa13.27□□□□□ -0.29
PTDSS1-202ENST00000517309 K7EP34 96 aa13.26□□□□□ -0.29
PTDSS1-202ENST00000517309 CXCL5P42830 114 aa13.26□□□□□ -0.29
PTDSS1-202ENST00000517309 DEFB1P60022 68 aa13.26□□□□□ -0.29
PTDSS1-202ENST00000517309 K7EQG2 157 aa13.26□□□□□ -0.29
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A1W2PPM0 123 aa13.26□□□□□ -0.29
PTDSS1-202ENST00000517309 SMIM9A6NGZ8 99 aa13.26□□□□□ -0.29
PTDSS1-202ENST00000517309 COX7B2Q8TF08 81 aa13.26□□□□□ -0.29
PTDSS1-202ENST00000517309 CARD19Q96LW7 228 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.6 ms