RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TAAR5	O14804	337 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV2-30	P06310	120 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511		Q0VG73	95 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	TWIST1	Q15672	202 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP69	Q49AA0	526 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf25	Q5T742	122 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	DPH3	Q96FX2	82 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	SGK494	Q96LW2	274 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	PARL	Q9H300	379 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	GCG	P01275	180 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-DQA1	P01909	254 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	BTC	P35070	178 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	GNG5	P63218	68 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	TVP23C	Q96ET8	276 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf85	Q96MD7	179 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L23	D6RBM5	183 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EQM0	130 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	6.96	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00694	P0DN24	101 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PTH2	Q96A98	100 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT15	Q9NV35	164 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511		Q9UF83	564 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPV4	95 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOD	O00212	210 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	TCRB	P04435	133 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	IL7	P13232	177 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SMUG1	Q53HV7	270 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ATRAID	Q6UW56	229 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	TNXB	P22105	4242 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	LYRM1	O43325	122 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PRNT	Q86SH4	94 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00479	Q96M42	142 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	JPT2	Q9H910	190 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PSG8	Q9UQ74	426 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS1	P07477	247 aa		6.92	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	IL15RA	Q13261	267 aa		6.92	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		6.92	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PANO1	I0J062	215 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	TCRA	P04437	139 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ENHO	Q6UWT2	76 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BVH4	76 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SIX6	O95475	246 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	C7orf33	Q8WU49	177 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		6.89	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511		B4DEV8	164 aa		6.89	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G10	O15496	165 aa		6.89	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PKIA	P61925	76 aa		6.89	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	MIA	Q16674	131 aa		6.89	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	MPV17L2	Q567V2	206 aa		6.89	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		6.89	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		6.89	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		6.89	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	IL36B	Q9NZH7	164 aa		6.89	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		6.88	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		6.88	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	6.88	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		6.88	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	hDV102S1	A0JD36	115 aa		6.88	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		6.88	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R381	172 aa		6.88	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	GAS8-AS1	O95177	125 aa		6.88	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PTTG1	O95997	202 aa		6.88	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		6.88	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB2A	P61019	212 aa		6.88	□□□□□ -1.31

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