RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 SYNJ2BPP57105 145 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 ZMAT4Q9H898 229 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 ZNF580Q9UK33 172 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 ACANP16112 2415 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 DPM2O94777 84 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 LAGE3Q14657 143 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 WNK1Q9H4A3 2382 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 MGPP08493 103 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 PSMG4Q5JS54 123 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 RASL10AQ92737 203 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 C20orf78Q9BR46 151 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 J3QLI3 93 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 ATP5LO75964 103 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 JPT2Q9H910 190 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 AKAP9Q99996 3911 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 A0A087WW49 117 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 ZNF702PQ9H963 129 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 ID1P41134 155 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 Q6YL49 198 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 ZNF479Q96JC4 524 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 KLLNB2CW77 178 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 FSHBP01225 129 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 MRAP2Q96G30 205 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 IGLL5B9A064 214 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 DEFB136Q30KP8 78 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.59□□□□□ -0.874e-11■□□□□ 9.7
PRAME-213ENST00000492657 CKS1BP61024 79 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 CEND1Q8N111 149 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 MTORP42345 2549 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 PTH2Q96A98 100 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 ITPR2Q14571 2701 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 CD7P09564 240 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 Q96MF0 132 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 HIST1H4GQ99525 98 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 HIGD1BQ9P298 99 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 A0A087WWL8 130 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 A0A087WX48 190 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GWB2 263 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 K7EQG2 157 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 DUX3Q96PT4 197 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 A0A0J9YX75 114 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 TMEM89A2RUT3 159 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 LINC00315P59091 139 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 C12orf74Q32Q52 190 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 MDFICQ9P1T7 246 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GV72 72 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 SLURP1P55000 103 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 E9PLD3 99 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 ELANEP08246 267 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 MED14OSP0DP75 135 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 CRYBA4P53673 196 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 FHL3Q13643 280 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 GAGE13Q4V321 117 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 SYT8Q8NBV8 401 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 NXPH4O95158 308 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 F5H697 171 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 H7C1H1 209 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 MT-ATP8P03928 68 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 PLNP26678 52 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 EMP1P54849 157 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 KNCNA6PVL3 124 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 F8VRH5 84 aa9.53□□□□□ -0.88
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