RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492354.1

SZRD1-210, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-210ENST00000492354 F8VRH5 84 aa7.15□□□□□ -1.26
SZRD1-210ENST00000492354 CD7P09564 240 aa7.15□□□□□ -1.26
SZRD1-210ENST00000492354 ZNF688P0C7X2 276 aa7.15□□□□□ -1.26
SZRD1-210ENST00000492354 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.15□□□□□ -1.26
SZRD1-210ENST00000492354 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.15□□□□□ -1.26
SZRD1-210ENST00000492354 MRAP2Q96G30 205 aa7.15□□□□□ -1.26
SZRD1-210ENST00000492354 LINC01546A6NGU7 62 aa7.15□□□□□ -1.27
SZRD1-210ENST00000492354 RNF223E7ERA6 249 aa7.15□□□□□ -1.27
SZRD1-210ENST00000492354 DUX5Q96PT3 197 aa7.15□□□□□ -1.27
SZRD1-210ENST00000492354 H3BMG7 143 aa7.14□□□□□ -1.27
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SZRD1-210ENST00000492354 Q96MF0 132 aa7.14□□□□□ -1.27
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SZRD1-210ENST00000492354 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
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SZRD1-210ENST00000492354 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.13□□□□□ -1.27
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SZRD1-210ENST00000492354 C12orf74Q32Q52 190 aa7.13□□□□□ -1.27
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SZRD1-210ENST00000492354 LINC01549A6NIU2 74 aa7.08□□□□□ -1.28
SZRD1-210ENST00000492354 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.08□□□□□ -1.28
SZRD1-210ENST00000492354 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.08□□□□□ -1.28
SZRD1-210ENST00000492354 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.08□□□□□ -1.28
SZRD1-210ENST00000492354 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.08□□□□□ -1.28
SZRD1-210ENST00000492354 PRM2P04554 102 aa7.08□□□□□ -1.28
SZRD1-210ENST00000492354 DCANP1Q8TF63 244 aa7.08□□□□□ -1.28
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