RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 CTRLP40313 264 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZQT7 251 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 IGHV4-31P0DP07 118 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 DYSFO75923 2080 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 HIVEP2P31629 2446 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 A0A0J9YX75 114 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 PPDPFLQ8WWR9 84 aa13.07□□□□□ -0.32
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NISCH-213ENST00000489895 C22orf34Q6ZV56 151 aa13.06□□□□□ -0.32
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NISCH-213ENST00000489895 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa13.06□□□□□ -0.32
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NISCH-213ENST00000489895 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 C11orf71Q6IPW1 123 aa13.05□□□□□ -0.32
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NISCH-213ENST00000489895 CCDC140Q96MF4 163 aa13.04□□□□□ -0.32
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NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PPM0 123 aa13.04□□□□□ -0.32
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NISCH-213ENST00000489895 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
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NISCH-213ENST00000489895 ZNF843Q8N446 348 aa13.03□□□□□ -0.32
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NISCH-213ENST00000489895 COX7A2LO14548 114 aa13.03□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 Q9HAA7 133 aa13.03□□□□□ -0.32
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NISCH-213ENST00000489895 C12orf74Q32Q52 190 aa13.02□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 C5orf38Q86SI9 138 aa13.02□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 ODF3Q96PU9 254 aa13.02□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 BRWD1-AS2P59051 145 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 RPL32P62910 135 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 CACNA1AO00555 2505 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 C19orf71A6NCJ1 209 aa13.02□□□□□ -0.33
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NISCH-213ENST00000489895 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
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NISCH-213ENST00000489895 DEFB135Q30KP9 77 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 LY6LH3BQJ8 138 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 CFC1BP0CG36 223 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 CFC1P0CG37 223 aa13□□□□□ -0.33
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NISCH-213ENST00000489895 GTSF1LQ9H1H1 148 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
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NISCH-213ENST00000489895 LINC01548A6NM66 108 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 K7EP13 123 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 PCP2Q8IVA1 136 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 CARD19Q96LW7 228 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 ETDBQ3ZM63 59 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 PRO0255Q9UI72 69 aa12.98□□□□□ -0.33
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NISCH-213ENST00000489895 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 NUP210LQ5VU65 1888 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 F8W735 103 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
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NISCH-213ENST00000489895 IGHV3-33P01772 117 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 COX7B2Q8TF08 81 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-213ENST00000489895 CEP192Q8TEP8 1941 aa12.96□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 ALPK3Q96L96 1907 aa12.96□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 IL17DQ8TAD2 202 aa12.96□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 CXCL5P42830 114 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 MED12LQ86YW9 2145 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 K7ERJ3 54 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 K7EQG2 157 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 MDFICQ9P1T7 246 aa12.94□□□□□ -0.34
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