RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-30P01768 117 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 UCNP55089 124 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 C19orf84I3L1E1 186 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 IGF1P05019 195 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 Q8N1Y9 231 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 C3orf56Q8N813 242 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 ATP6V0E1O15342 81 aa10.21□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 BUB3O43684 328 aa10.21□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 SAA4P35542 130 aa10.21□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 ASIPP42127 132 aa10.21□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 C15orf32Q32M92 178 aa10.21□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 SBSPONQ8IVN8 264 aa10.21□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa10.21□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 EBI3Q14213 229 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 C15orf53Q8NAA6 179 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 TSPEAR-AS2P59090 65 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 RPL39P62891 51 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 C16orf92Q96LL3 132 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 RBAKDNA6NC62 111 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 CRYGDP07320 174 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 MINOS1Q5TGZ0 78 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 CLEC19AQ6UXS0 136 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 LINC00527Q9UJ94 153 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 MEIG1Q5JSS6 88 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 TMEM219Q86XT9 240 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 SPG11Q96JI7 2443 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 F5H697 171 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 J3QQQ9 107 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 PRR9Q5T870 116 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 LMO4P61968 165 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 PMVKQ15126 192 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 DEFB1P60022 68 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 CCDC140Q96MF4 163 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 FLNCQ14315 2725 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-33P01772 117 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 PRSS2P07478 247 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 ELANEP08246 267 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 UBE2E1P51965 193 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 FAM110AQ9BQ89 295 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 OOSP1A8MZH6 123 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 ATXN8Q156A1 80 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 LINC01620Q4KN68 170 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 MUSTN1Q8IVN3 82 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 CLPSL1A2RUU4 121 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 GNRH2O43555 120 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 TSHBP01222 138 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 METTL26Q96S19 204 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-212ENST00000488380 ZNF56Q15929 161 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 ZNRF2Q8NHG8 242 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 GNLYP22749 145 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 C2orf82Q6UX34 121 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 ODF3Q96PU9 254 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 H3BMM0 161 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 NPFFO15130 113 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 OR10J6PQ8NGY7 276 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 UBE2WQ96B02 151 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 A0A087WWL8 130 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 TRAV21A0A0B4J279 112 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 JPT2Q9H910 190 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R17O96001 155 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 IGIPA6NJ69 53 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 RNF223E7ERA6 249 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 GPHB5Q86YW7 130 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 DUX3Q96PT4 197 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 C5orf56Q8N8D9 126 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 F6UB75 175 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-212ENST00000488380 NPC2P61916 151 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.2 ms