RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.61□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 KMT2AQ03164 3969 aa9.61□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF727A8MUV8 499 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 RAB4BP61018 213 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 CLLU1Q5K131 121 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 JPT2Q9H910 190 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 OSTCQ9NRP0 149 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00694P0DN24 101 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 SRIP30626 198 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00315P59091 139 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 RAB14P61106 215 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 Q6ZSN1 163 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-240ENST00000484412 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 A8MWL6 223 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 C9JQL5 133 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 M0R381 172 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 IFITM2Q01629 132 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 CTRLP40313 264 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 SIVA1O15304 175 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 NTF3P20783 257 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 NAT8Q9UHE5 227 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 GZMBP10144 247 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 ERVFC1-1P60608 527 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 TTC32Q5I0X7 151 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 FRZBQ92765 325 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 ISOC2Q96AB3 205 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 A0A087WWC5 75 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 TRGC1P0CF51 173 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 LELP1Q5T871 98 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 TSKUQ8WUA8 353 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 GTSF1Q8WW33 167 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 A0A087WWL8 130 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 AP1S3Q96PC3 154 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 Q9UF83 564 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 V9GYV3 84 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-240ENST00000484412 RTL8CO15255 209 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 SMIM17P0DL12 118 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 CEBPGP53567 150 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 UBE2D3P61077 147 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 UBE2D2P62837 147 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 H7C1H1 209 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 M0QY20 66 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 UQCC3Q6UW78 93 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 M0R2N4 97 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 EVI2AP22794 236 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 GAGE12JA6NER3 117 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 GAGE1Q13065 139 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 GAGE4Q13068 117 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 GAGE5Q13069 117 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 GAGE13Q4V321 117 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 C6orf223Q8N319 242 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 DNAH2Q9P225 4427 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.48□□□□□ -0.89
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