RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SRRT-210ENST00000477529 Q9UF83 564 aa9.61□□□□□ -0.87
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SRRT-210ENST00000477529 TMEM250H0YL14 139 aa9.6□□□□□ -0.87
SRRT-210ENST00000477529 CRYGDP07320 174 aa9.6□□□□□ -0.87
SRRT-210ENST00000477529 TIRAPP58753 221 aa9.6□□□□□ -0.87
SRRT-210ENST00000477529 TOR2AQ5JU69 321 aa9.6□□□□□ -0.87
SRRT-210ENST00000477529 K7EN84 100 aa9.59□□□□□ -0.87
SRRT-210ENST00000477529 IGLC6P0CF74 106 aa9.59□□□□□ -0.87
SRRT-210ENST00000477529 GZMBP10144 247 aa9.59□□□□□ -0.87
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SRRT-210ENST00000477529 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.58□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.58□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.58□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 LINC00315P59091 139 aa9.58□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 TNP2Q05952 138 aa9.58□□□□□ -0.88
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SRRT-210ENST00000477529 GAGE12JA6NER3 117 aa9.57□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 P01737 135 aa9.57□□□□□ -0.88
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SRRT-210ENST00000477529 GAGE5Q13069 117 aa9.57□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 GAGE13Q4V321 117 aa9.57□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.57□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 OCC1Q8TAD7 63 aa9.57□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.57□□□□□ -0.88
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SRRT-210ENST00000477529 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.56□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 TEX261Q6UWH6 196 aa9.56□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.56□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.56□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 NUDT11Q96G61 164 aa9.56□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.56□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.55□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 ZNF56Q15929 161 aa9.55□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 LELP1Q5T871 98 aa9.55□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 AP1S3Q96PC3 154 aa9.55□□□□□ -0.88
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SRRT-210ENST00000477529 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.54□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.54□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 XKRY2A2RUG3 117 aa9.54□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 CTRLP40313 264 aa9.54□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 CEBPGP53567 150 aa9.54□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 RAB4BP61018 213 aa9.54□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 SSTP61278 116 aa9.54□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.54□□□□□ -0.88
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SRRT-210ENST00000477529 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.54□□□□□ -0.88
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SRRT-210ENST00000477529 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.53□□□□□ -0.88
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SRRT-210ENST00000477529 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.53□□□□□ -0.88
SRRT-210ENST00000477529 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.52□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 F2Z2F3 143 aa9.52□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 CACNG7P62955 275 aa9.52□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.52□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.52□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 UBE2D3P61077 147 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 UBE2D2P62837 147 aa9.51□□□□□ -0.89
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SRRT-210ENST00000477529 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 LINC01551Q86U37 167 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 Q8N3U1 123 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 CNFNQ9BYD5 112 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 ZNF727A8MUV8 499 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 SMIM17P0DL12 118 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 GTSF1Q8WW33 167 aa9.5□□□□□ -0.89
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SRRT-210ENST00000477529 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.49□□□□□ -0.89
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SRRT-210ENST00000477529 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 MGPP08493 103 aa9.48□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 TRGC1P0CF51 173 aa9.48□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 ERVFC1-1P60608 527 aa9.48□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 NFE4Q86UQ8 179 aa9.48□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.47□□□□□ -0.89
SRRT-210ENST00000477529 CT83Q5H943 113 aa9.47□□□□□ -0.89
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