RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	RHOD	O00212	210 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	PSCA	O43653	123 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	AKR1C3	P42330	323 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	UBE2G1	P62253	170 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	CST9LP1	Q5W188	147 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	7.94	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	MLST8	Q9BVC4	326 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A087WWL8	130 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	HMSD	A8MTL9	139 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	HAMP	P81172	84 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464		Q5VSD8	79 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	SYT8	Q8NBV8	401 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	STOML3	Q8TAV4	291 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		7.93	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A087WWC5	75 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	UMAD1	C9J7I0	102 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464		M0R381	172 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	BCL2L11	O43521	198 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	CXCL1	P09341	107 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	ZFP82	Q8N141	532 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1B0GV50	99 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	NIT1	Q86X76	327 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A0D9SG52	128 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	SNAI2	O43623	268 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	UBE2D3	P61077	147 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	UBE2D2	P62837	147 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	CCL20	P78556	96 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	PRR27	Q6MZM9	219 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	LECT2	O14960	151 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464		Q6ZSA8	131 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	C11orf52	Q96A22	123 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	TM2D2	Q9BX73	214 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	C1QB	P02746	253 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	OR5AL1	P0C617	328 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	TMUB2	Q71RG4	321 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	BAGE2	Q86Y30	109 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	FRZB	Q92765	325 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	DERL1	Q9BUN8	251 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	PFDN1	O60925	122 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLV2-8	P01709	118 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	TOR2A	Q5JU69	321 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	ATRAID	Q6UW56	229 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		7.87	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB4B	P61018	213 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	BAALC	Q8WXS3	180 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	KLK12	Q9UKR0	248 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		7.85	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		7.85	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLC6	P0CF74	106 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF56	Q15929	161 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC01620	Q4KN68	170 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	ENHO	Q6UWT2	76 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	UBE2W	Q96B02	151 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	GNG13	Q9P2W3	67 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	COX11	Q9Y6N1	276 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PTPRF-211	ENST00000467464	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		7.83	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		7.83	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM229A	H3BQW9	127 aa		7.83	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	SULT1A2	P50226	295 aa		7.83	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	MPV17L2	Q567V2	206 aa		7.83	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	CENPW	Q5EE01	88 aa		7.83	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		7.83	□□□□□ -1.16

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