RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 MRAP2Q96G30 205 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 NACAE9PAV3 2078 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 NPYP01303 97 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 CRYGDP07320 174 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 SMIM17P0DL12 118 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 APOC4P55056 127 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.65□□□□□ -0.06
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HDDC3-202ENST00000394272 C16orf74Q96GX8 76 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC3-202ENST00000394272 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC3-202ENST00000394272 S100A2P29034 98 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDDC3-202ENST00000394272 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDDC3-202ENST00000394272 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC3-202ENST00000394272 FABP4P15090 132 aa14.6□□□□□ -0.07
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HDDC3-202ENST00000394272 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HDDC3-202ENST00000394272 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC3-202ENST00000394272 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HDDC3-202ENST00000394272 DEFB135Q30KP9 77 aa14.59□□□□□ -0.07
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HDDC3-202ENST00000394272 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC3-202ENST00000394272 UFSP1Q6NVU6 142 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC3-202ENST00000394272 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.59□□□□□ -0.07
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HDDC3-202ENST00000394272 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.58□□□□□ -0.08
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HDDC3-202ENST00000394272 RS1O15537 224 aa14.57□□□□□ -0.08
HDDC3-202ENST00000394272 HSBP1O75506 76 aa14.57□□□□□ -0.08
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HDDC3-202ENST00000394272 AMTP48728 403 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-202ENST00000394272 Q6ZWC4 215 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-202ENST00000394272 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-202ENST00000394272 AP5S1Q9NUS5 200 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-202ENST00000394272 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.55□□□□□ -0.08
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HDDC3-202ENST00000394272 PMCHP20382 165 aa14.55□□□□□ -0.08
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HDDC3-202ENST00000394272 C20orf78Q9BR46 151 aa14.54□□□□□ -0.08
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HDDC3-202ENST00000394272 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa14.54□□□□□ -0.08
HDDC3-202ENST00000394272 LINC01546A6NGU7 62 aa14.53□□□□□ -0.08
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HDDC3-202ENST00000394272 RNF183Q96D59 192 aa14.53□□□□□ -0.08
HDDC3-202ENST00000394272 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
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HDDC3-202ENST00000394272 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.52□□□□□ -0.08
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HDDC3-202ENST00000394272 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.52□□□□□ -0.09
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HDDC3-202ENST00000394272 OR4C5Q8NGB2 326 aa14.5□□□□□ -0.09
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HDDC3-202ENST00000394272 Q6ZSN1 163 aa14.49□□□□□ -0.09
HDDC3-202ENST00000394272 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.49□□□□□ -0.09
HDDC3-202ENST00000394272 A0A096LNJ9 63 aa14.48□□□□□ -0.09
HDDC3-202ENST00000394272 GAGE12BA1L429 117 aa14.48□□□□□ -0.09
HDDC3-202ENST00000394272 H7C1H1 209 aa14.48□□□□□ -0.09
HDDC3-202ENST00000394272 GAGE7O76087 117 aa14.48□□□□□ -0.09
HDDC3-202ENST00000394272 IGHV3-53P01767 116 aa14.48□□□□□ -0.09
HDDC3-202ENST00000394272 GAGE12FP0CL80 117 aa14.48□□□□□ -0.09
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