RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa15.65■□□□□ 0.1
CCSAP-203ENST00000366687 CGB7P0DN87 165 aa15.65■□□□□ 0.1
CCSAP-203ENST00000366687 IFITM1P13164 125 aa15.65■□□□□ 0.1
CCSAP-203ENST00000366687 GYPEP15421 78 aa15.65■□□□□ 0.1
CCSAP-203ENST00000366687 KIR2DL5AQ8N109 375 aa15.65■□□□□ 0.1
CCSAP-203ENST00000366687 SH2D6Q7Z4S9 175 aa15.65■□□□□ 0.1
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS47A8MTI9 375 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0J9YXV3 536 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 LINC01545Q5VT33 79 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 K7EQD1 137 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 GTSF1Q8WW33 167 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 Q8N1Y9 231 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 MYO9AB2RTY4 2548 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf153Q5TBE3 101 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 MRAPQ8TCY5 172 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 FANCD2OSQ96PS1 177 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 ABCA2Q9BZC7 2435 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 MED14OSP0DP75 135 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB125Q8N687 156 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 Q9HAA7 133 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 ICOSQ9Y6W8 199 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 NUPR1O60356 82 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 NCKAP5O14513 1909 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 MYCNOSP40205 109 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV4A0A0B4J268 109 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 IGHG4P01861 327 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 CTRLP40313 264 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD39Q53RE8 183 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2BP63146 152 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00173Q6ZV60 143 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF503Q96F45 646 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-203ENST00000366687 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00574Q9H8X3 128 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 KMT2EQ8IZD2 1858 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZVH6 145 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 GAGE12HA6NDE8 117 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 COX7A2LO14548 114 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 P0C879 139 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 CAMK2N2Q96S95 79 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf1Q9H5F2 150 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 CCL25O15444 150 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 CCL18P55774 89 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 CDPF1Q6NVV7 123 aa15.56■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 PROP1O75360 226 aa15.56■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 A6NDX4 124 aa15.56■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 BAALC-AS2P0C853 105 aa15.56■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 ORMDL1Q9P0S3 153 aa15.56■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 TIMM17AQ99595 171 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM61Q8N0U2 210 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 LMO4P61968 165 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD29Q8N6D5 301 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 PKIGQ9Y2B9 76 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 COL4A3Q01955 1670 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 CLPSL1A2RUU4 121 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 H0YGX0 51 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 RPL39P62891 51 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 C4orf3Q8WVX3 66 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0J9YX75 114 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 A4D1N5 150 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 IGF2RP11717 2491 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 C19orf71A6NCJ1 209 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 IGLL5B9A064 214 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 HHLA3Q9XRX5 114 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB1P60022 68 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 MUSTN1Q8IVN3 82 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 COX7B2Q8TF08 81 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 ODF3BA8MYP8 253 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 CRYBA4P53673 196 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 TDRG1Q3Y452 100 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 TOMM6Q96B49 74 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 ESM1Q9NQ30 184 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV12-3P01733 135 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 C15orf53Q8NAA6 179 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 HIGD1BQ9P298 99 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV3-30P01768 117 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV3-33P01772 117 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 INSL3P51460 131 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 BAALCQ8WXS3 180 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf16Q68DN1 1984 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 hADV29S1A0JD25 119 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms