RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 SLURP1P55000 103 aa13.55□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 GAGE2AQ6NT46 116 aa13.55□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 C2orf70A6NJV1 201 aa13.55□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 YPEL4Q96NS1 127 aa13.55□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 CCL24O00175 119 aa13.55□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 GPHB5Q86YW7 130 aa13.54□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 ODF3BA8MYP8 253 aa13.54□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 SPANXA1Q9NS26 97 aa13.54□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 CFC1BP0CG36 223 aa13.54□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 CFC1P0CG37 223 aa13.54□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 MBD6Q96DN6 1003 aa13.54□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 HCFC1P51610 2035 aa13.53□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 TTTY13Q9BZ97 58 aa13.53□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 CEP192Q8TEP8 1941 aa13.53□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 MED14OSP0DP75 135 aa13.53□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 DEFB113Q30KQ7 82 aa13.53□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 FSTL3O95633 263 aa13.52□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa13.52□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 APRG1Q8IVJ8 170 aa13.52□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 RNF152Q8N8N0 203 aa13.52□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa13.52□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 DEFB1P60022 68 aa13.52□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 LMO4P61968 165 aa13.52□□□□□ -0.24
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa13.52□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 A0A0J9YXV3 536 aa13.52□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 GDF5OSQ5U4N7 250 aa13.52□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 HIGD1BQ9P298 99 aa13.52□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 GAGE12HA6NDE8 117 aa13.52□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 J3QKU1 62 aa13.52□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 Q8N1Y9 231 aa13.52□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa13.51□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 IGLL5B9A064 214 aa13.51□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.51□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 NXPH4O95158 308 aa13.5□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 NRGNQ92686 78 aa13.5□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa13.5□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 A0A087WW49 117 aa13.5□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CRYGBP07316 175 aa13.5□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 FXYD2P54710 66 aa13.5□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 APOC4P55056 127 aa13.5□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DSCAMO60469 2012 aa13.5□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ODF1Q14990 250 aa13.5□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 C3orf56Q8N813 242 aa13.5□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ABCA2Q9BZC7 2435 aa13.5□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC140Q96MF4 163 aa13.49□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa13.49□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM89A2RUT3 159 aa13.49□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 Q9H8V8 135 aa13.49□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa13.48□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TRBV12-3P01733 135 aa13.48□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DEFB121Q5J5C9 76 aa13.48□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SOCS3O14543 225 aa13.48□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TAX1BP3O14907 124 aa13.48□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 RPL39P62891 51 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CARD19Q96LW7 228 aa13.48□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TOMM6Q96B49 74 aa13.47□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TANC2Q9HCD6 1990 aa13.47□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 A6NDX4 124 aa13.47□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 LINC01548A6NM66 108 aa13.47□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TIMM17AQ99595 171 aa13.47□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 BAALCQ8WXS3 180 aa13.46□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DSCAML1Q8TD84 2053 aa13.46□□□□□ -0.25
SCARB2-201ENST00000264896 PRSS47A8MTI9 375 aa13.46□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 ANGP03950 147 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 E9PLD3 99 aa13.45□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 IGLC6P0CF74 106 aa13.45□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 A0A096LPF7 62 aa13.45□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.45□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 IFITM1P13164 125 aa13.45□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 A4D1N5 150 aa13.44□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.44□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 LY6LH3BQJ8 138 aa13.44□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 Q71RC1 249 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 A0A0J9YX75 114 aa13.44□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 PRB1P04280 392 aa13.44□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 EBI3Q14213 229 aa13.44□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.44□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 CEP295Q9C0D2 2601 aa13.44□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.43□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 MYCNOSP40205 109 aa13.43□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.43□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 PTPRSQ13332 1948 aa13.43□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 HERV-K104P63124 156 aa13.43□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 C11orf86A6NJI1 115 aa13.42□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 MUSTN1Q8IVN3 82 aa13.41□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 MDFICQ9P1T7 246 aa13.41□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 XCL1P47992 114 aa13.41□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 CLPSL2Q6UWE3 100 aa13.41□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 IGF1P05019 195 aa13.41□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.4 ms