RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000204005.13

LTBP4-201, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTBP4, Length 5,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-201ENST00000204005 PPDPFLQ8WWR9 84 aa14.66□□□□□ -0.06
LTBP4-201ENST00000204005 JPT2Q9H910 190 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-201ENST00000204005 C9orf66Q5T8R8 295 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-201ENST00000204005 PRO1854Q9UHT4 67 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-201ENST00000204005 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-201ENST00000204005 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-201ENST00000204005 LEPROTO15243 131 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 AMTNQ6UX39 209 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 EBI3Q14213 229 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 MBD6Q96DN6 1003 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 LY6LH3BQJ8 138 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 TAX1BP3O14907 124 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 MLST8Q9BVC4 326 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 CRYGBP07316 175 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 RHOHQ15669 191 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 SPRY2O43597 315 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 GAGE6Q13070 117 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 CCDC140Q96MF4 163 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 TRBV12-3P01733 135 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 LINC01548A6NM66 108 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 IGF1P05019 195 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 FGF6P10767 208 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF843Q8N446 348 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 IGHG4P01861 327 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 GATD1Q8NB37 220 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 MYCNOSP40205 109 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 GAGE12HA6NDE8 117 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 OVOL2Q9BRP0 275 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 HIGD1BQ9P298 99 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 PLXNB1O43157 2135 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.58□□□□□ -0.07
LTBP4-201ENST00000204005 H3BMM0 161 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 PSCAO43653 123 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 UBE2WQ96B02 151 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 IGLL5B9A064 214 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 VWC2LB2RUY7 222 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.56□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.56□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 Q6YL49 198 aa14.56□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 C16orf74Q96GX8 76 aa14.56□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 FXYD2P54710 66 aa14.56□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.56□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 HERVK_113P63121 156 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 MED14OSP0DP75 135 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 Q8N1Y9 231 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 ODF1Q14990 250 aa14.54□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 WFDC11Q8NEX6 87 aa14.54□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.54□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 DEFB1P60022 68 aa14.54□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 A0A0J9YX75 114 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 CDSNQ15517 529 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 A0A096LPF7 62 aa14.52□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.52□□□□□ -0.08
LTBP4-201ENST00000204005 PIFOQ8TCI5 191 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 CFC1BP0CG36 223 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 CFC1P0CG37 223 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 SPANXA1Q9NS26 97 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 ANGP03950 147 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 TOMM6Q96B49 74 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 PFN2P35080 140 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 HCFC1P51610 2035 aa14.49□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.49□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 A0A0J9YY99 117 aa14.49□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 GAGE2AQ6NT46 116 aa14.48□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 NACAE9PAV3 2078 aa14.48□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 IGLC6P0CF74 106 aa14.48□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.48□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 ZMAT4Q9H898 229 aa14.48□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 BAALCQ8WXS3 180 aa14.48□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.47□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 Q8N6K4 173 aa14.47□□□□□ -0.09
LTBP4-201ENST00000204005 K7EQD1 137 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms