RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV2-11	P01706	119 aa		7.84	□□□□□ -1.15
TTLL3-233	ENST00000602338	TCRA	P04437	139 aa		7.84	□□□□□ -1.15
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		7.84	□□□□□ -1.15
TTLL3-233	ENST00000602338	ENKUR	Q8TC29	256 aa		7.84	□□□□□ -1.15
TTLL3-233	ENST00000602338	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		7.84	□□□□□ -1.15
TTLL3-233	ENST00000602338	BAALC	Q8WXS3	180 aa		7.84	□□□□□ -1.15
TTLL3-233	ENST00000602338	PARL	Q9H300	379 aa		7.84	□□□□□ -1.15
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		7.83	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	GAGE12J	A6NER3	117 aa		7.83	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	GAGE1	Q13065	139 aa		7.83	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	GAGE4	Q13068	117 aa		7.83	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	GAGE5	Q13069	117 aa		7.83	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.83	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	PTH2	Q96A98	100 aa		7.83	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		7.83	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PPV4	95 aa		7.82	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	GGTLC3	B5MD39	225 aa		7.82	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	TAAR5	O14804	337 aa		7.82	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	IFITM3	Q01628	133 aa		7.82	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		7.82	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		7.82	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	JPT2	Q9H910	190 aa		7.82	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	PSG8	Q9UQ74	426 aa		7.82	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		7.81	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		7.81	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	STAG3L2	P0CL84	134 aa		7.81	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	STAG3L3	P0CL85	134 aa		7.81	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	PRNT	Q86SH4	94 aa		7.81	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		7.81	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		7.81	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		7.81	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00479	Q96M42	142 aa		7.81	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		7.81	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		7.81	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		7.8	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	UPK1B	O75841	260 aa		7.8	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	PET100	P0DJ07	73 aa		7.8	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	GCHFR	P30047	84 aa		7.8	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	SMUG1	Q53HV7	270 aa		7.8	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		7.8	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		7.8	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		7.8	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	SUN5	Q8TC36	379 aa		7.8	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		7.79	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		7.79	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MWV9	139 aa		7.79	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP69	Q49AA0	526 aa		7.79	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	TOR2A	Q5JU69	321 aa		7.79	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		7.79	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	NIT1	Q86X76	327 aa		7.79	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB24	Q969Q5	203 aa		7.79	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF222	A6NCQ9	220 aa		7.78	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	SSNA1	O43805	119 aa		7.78	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	7.78	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		7.78	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		7.78	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		7.78	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		7.78	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	KLK12	Q9UKR0	248 aa		7.78	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338	EPDR1	Q9UM22	224 aa		7.78	□□□□□ -1.16
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WWC5	75 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338		H3BVH4	76 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338		K7EQM0	130 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338		Q8N976	141 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SYT8	Q8NBV8	401 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	S100Z	Q8WXG8	99 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	COX11	Q9Y6N1	276 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	OXT	P01178	125 aa		7.76	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ASIP	P42127	132 aa		7.76	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ATRAID	Q6UW56	229 aa		7.76	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2W	Q96B02	151 aa		7.76	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	RMI2	Q96E14	147 aa		7.76	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		7.76	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	IL36B	Q9NZH7	164 aa		7.76	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV2-8	P01709	118 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP6V0C	P27449	155 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338		Q86TA4	180 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WWL8	130 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GVG6	124 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338		B4DEV8	164 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338		M0R036	132 aa		7.74	□□□□□ -1.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms