RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 A0A087X002 238 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV3A0A0B4J244 114 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0B4J2C4 111 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GWA3 101 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 A6NN06 94 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 CEBPZOSA8MTT3 80 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 H3BMM0 161 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 H3BVH4 76 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 PEX7O00628 323 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 LEPROTO15243 131 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 PPYP01298 95 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV2-8P01709 118 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF32P17041 273 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 LPAL2Q16609 132 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 KIF26BQ2KJY2 2108 aa2.19□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.19□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 MIR17HGQ75NE6 70 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa2.19□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.19□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 BCORQ6W2J9 1755 aa2.18□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 H7BZZ5 65 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV1D-12P01611 117 aa2.18□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 LYPD5Q6UWN5 251 aa2.18□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa2.17□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 C3orf84H3BNL1 204 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 K7EQG2 157 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 TSHBP01222 138 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 S100A3P33764 101 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 DYNLT1P63172 113 aa2.17□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 C17orf58Q2M2W7 97 aa2.17□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 CD163L1Q9NR16 1453 aa2.17□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 MGAMO43451 1857 aa2.17□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 AGRNO00468 2067 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 DSCAML1Q8TD84 2053 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa2.16□□□□□ -2.06
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