RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 SYT8Q8NBV8 401 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-209ENST00000566833 C9orf85Q96MD7 179 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-209ENST00000566833 IL36BQ9NZH7 164 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-209ENST00000566833 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-209ENST00000566833 LINC00862A6NCI5 91 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF876PQ49A33 203 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 TPPP3Q9BW30 176 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 F5H768 121 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 MED14OSP0DP75 135 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 GZMBP10144 247 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 RASL10AQ92737 203 aa9.57□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 M0R381 172 aa9.56□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 IGHV3-53P01767 116 aa9.56□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZFP82Q8N141 532 aa9.56□□□□□ -0.88
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CCNDBP1-209ENST00000566833 OSTCQ9NRP0 149 aa9.56□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 F8W036 122 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 LCE2BO14633 110 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 PTH2Q96A98 100 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 SFRP2Q96HF1 295 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 C18orf15Q96N68 181 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.55□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 A0A1W2PPQ1 181 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMEM218A2RU14 115 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 A8MWL6 223 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 IGLL5B9A064 214 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 OR5AL1P0C617 328 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 SSTP61278 116 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 CT83Q5H943 113 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 CASC10Q5T4H9 136 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.54□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 A8MWV9 139 aa9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 SNAI2O43623 268 aa9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF575Q86XF7 245 aa9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.53□□□□□ -0.88
CCNDBP1-209ENST00000566833 MUC4Q99102 2169 aa9.53□□□□□ -0.88
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CCNDBP1-209ENST00000566833 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.52□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 F2Z2F3 143 aa9.52□□□□□ -0.89
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CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF479Q96JC4 524 aa9.52□□□□□ -0.89
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CCNDBP1-209ENST00000566833 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.52□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 RS1O15537 224 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 CIDEAO60543 219 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 HOXA5P20719 270 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLAQ13239 276 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.51□□□□□ -0.89
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CCNDBP1-209ENST00000566833 TSKUQ8WUA8 353 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 SEC11CQ9BY50 192 aa9.51□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 PPP1R2P9O14990 202 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 MT-ND4LP03901 98 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMIM17P0DL12 118 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 TCTAP57738 103 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 V9GYV3 84 aa9.5□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.49□□□□□ -0.89
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CCNDBP1-209ENST00000566833 ADCYAP1P18509 176 aa9.49□□□□□ -0.89
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CCNDBP1-209ENST00000566833 FHL2Q14192 279 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 AP1S3Q96PC3 154 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.49□□□□□ -0.89
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CCNDBP1-209ENST00000566833 PRO0255Q9UI72 69 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 A0A087WWL8 130 aa9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM231BA6NCW3 169 aa9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 PAX4O43316 350 aa9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRGC1P0CF51 173 aa9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 TWIST1Q15672 202 aa9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 WDR73Q6P4I2 378 aa9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-209ENST00000566833 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.48□□□□□ -0.89
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