RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561304.5

ZEB1-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 1 (best)

Gene ZEB1, Length 1,383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-223	ENST00000561304	GAGE13	Q4V321	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	SPX	Q9BT56	116 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304		M0R2P5	195 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	GYPE	P15421	78 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	LINC00479	Q96M42	142 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	PSG8	Q9UQ74	426 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	FAT1	Q14517	4588 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	SMLR1	H3BR10	107 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	CXorf1	O96002	111 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	GCG	P01275	180 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	SRI	P30626	198 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	UBE2G2	P60604	165 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	SERF2	P84101	59 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	SLA	Q13239	276 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	PRNT	Q86SH4	94 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	ASB13	Q8WXK3	278 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	C9orf85	Q96MD7	179 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	EPDR1	Q9UM22	224 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304		C9JCJ5	164 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	CDK2AP2	O75956	126 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	TNFRSF6B	O95407	300 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	MB	P02144	154 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	MAL	P21145	153 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304		Q86TA4	180 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	KCNS1	Q96KK3	526 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A1W2PRE2	83 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM74A7	A6NL05	159 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	RS1	O15537	224 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF876P	Q49A33	203 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	SMUG1	Q53HV7	270 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304		K7EQM0	130 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	PEX7	O00628	323 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	TAAR5	O14804	337 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	ARPC5	O15511	151 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	ORM1	P02763	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	FHIT	P49789	147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	JPT2	Q9H910	190 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304		Q9UF83	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A087WTM6	91 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	CRIP1	P50238	77 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304		H3BVH4	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	IFNA7	P01567	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	CRYGD	P07320	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304		Q8N1X5	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZEB1-223	ENST00000561304	PTH2	Q96A98	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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