RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.35□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.35□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.35□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 A0A0J9YX75 114 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 C9orf118A6NHY6 69 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 F6UB75 175 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 LINC01619G3V211 115 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 J3QKU1 62 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 K7EP13 123 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-205ENST00000546891 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 CBY3A6NI87 242 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 ERASQ7Z444 233 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 PCP2Q8IVA1 136 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TMEM141Q96I45 108 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 C9orf85Q96MD7 179 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 ZNF702PQ9H963 129 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TMEM160Q9NX00 188 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 NBASA2RRP1 2371 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 VCYO14598 125 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 GNRH2O43555 120 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 CD7P09564 240 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 CDKN1BP46527 198 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 Q6ZQT7 251 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 Q8N2B8 174 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TMEM86BQ8N661 226 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 KIR2DL4Q99706 377 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 CSTL1Q9H114 145 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 PEMTQ9UBM1 199 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 COL12A1Q99715 3063 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 OR11H12B2RN74 326 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 ZNF688P0C7X2 276 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 SMIM13P0DJ93 91 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 SRD5A1P18405 259 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 HERVK_113P61574 105 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 Q6ZVH6 145 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 OR11H1Q8NG94 326 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 OR11H2Q8NH07 326 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 JMJD8Q96S16 334 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 GAGE10A6NGK3 116 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 RNF223E7ERA6 249 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 RIPPLY3P57055 190 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 SYNJ2BPP57105 145 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 LINC00315P59091 139 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 DEFB1P60022 68 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 RHOHQ15669 191 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 BAALCQ8WXS3 180 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 NRGNQ92686 78 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TIMM17AQ99595 171 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TM2D2Q9BX73 214 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 E9PLD3 99 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 GCSHP23434 173 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 Q5PR19 223 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 CEND1Q8N111 149 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 A8MTW9 85 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-205ENST00000546891 F5H697 171 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 223.2 ms