RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HERVK_113P61574 105 aa5.08□□□□□ -1.6
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.08□□□□□ -1.6
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.06□□□□□ -1.6
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.06□□□□□ -1.6
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 BATFQ16520 125 aa5.04□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MPV17L2Q567V2 206 aa5.04□□□□□ -1.6
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-208ENST00000529667 STPG4Q8N801 248 aa5.04□□□□□ -1.6
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 OR11H2Q8NH07 326 aa5.04□□□□□ -1.6
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 LRRK2Q5S007 2527 aa5.04□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NAV2Q8IVL1 2488 aa5.04□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.03□□□□□ -1.6
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 SMKR1H3BMG3 65 aa5.03□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-208ENST00000529667 INSP01308 110 aa5.03□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LINC00315P59091 139 aa5.03□□□□□ -1.6
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.03□□□□□ -1.6
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