RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 NXPH4O95158 308 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 LEPROTL1O95214 131 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 KIAA0087Q14695 138 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 LCE1DQ5T752 114 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF492Q9P255 531 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 UBE2D3P61077 147 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 UBE2D2P62837 147 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF876PQ49A33 203 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00596Q86U02 117 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 GGNQ86UU5 652 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 Q8N2B8 174 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 SPTSSAQ969W0 71 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 TRBV12-3P01733 135 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 CKS2P33552 79 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 DYNLT3P51808 116 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 C6orf223Q8N319 242 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 RNF185Q96GF1 192 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 C17orf77Q96MU5 243 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 H3BMM0 161 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 FSTL3O95633 263 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 CLPSP04118 112 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 MFAP2P55001 183 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 CCL20P78556 96 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF56Q15929 161 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC48A1Q6P1K1 146 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF843Q8N446 348 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 UBE2WQ96B02 151 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 GPHA2Q96T91 129 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-214ENST00000497648 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.59□□□□□ -1.35
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RABGGTB-214ENST00000497648 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC25A20O43772 301 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
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RABGGTB-214ENST00000497648 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 Q8N8P6 123 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 RFESDQ8TAC1 157 aa6.58□□□□□ -1.36
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RABGGTB-214ENST00000497648 TACC2O95359 2948 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.57□□□□□ -1.36
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RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00473A8K010 186 aa6.57□□□□□ -1.36
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RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV3-11P04433 115 aa6.57□□□□□ -1.36
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RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 UBE2AP49459 152 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF117Q03924 483 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.57□□□□□ -1.36
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RABGGTB-214ENST00000497648 V9GY05 133 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 MPDZO75970 2070 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 A6NIN4 97 aa6.56□□□□□ -1.36
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RABGGTB-214ENST00000497648 CCKP06307 115 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 FXYD2P54710 66 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 C6orf99Q4VX62 202 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 MARCH3Q86UD3 253 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 ITPR2Q14571 2701 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A0J9YXV3 536 aa6.55□□□□□ -1.36
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