RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	RBAKDN	A6NC62	111 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CCS	O14618	274 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A11	P31949	105 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A10	P60903	97 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF876P	Q49A33	203 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	OR7C2	O60412	319 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CIDEA	O60543	219 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	SULT1A1	P50225	295 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TMBIM6	P55061	237 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIQK	Q629K1	86 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	HYLS1	Q96M11	299 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511		V9GYH0	126 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPX	A8MT69	81 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV2-11	P01706	119 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TYMS	P04818	313 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC11B	P0C7V7	166 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V1F	Q16864	119 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	MITD1	Q8WV92	249 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB13	Q8WXK3	278 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNS1	Q96KK3	526 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE12J	A6NER3	117 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511		F6UZH7	168 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE1	Q13065	139 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE4	Q13068	117 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE5	Q13069	117 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	THAP6	Q8TBB0	222 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	FXYD5	Q96DB9	178 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	NMES1	Q9C002	83 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	IGSF23	A1L1A6	192 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF222	A6NCQ9	220 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BMQ9	156 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	C14orf177	Q52M58	125 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2W	Q96B02	151 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf50	Q96LR7	162 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TREM1	Q9NP99	234 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WWC5	75 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TMED6	Q8WW62	240 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK12	Q9UKR0	248 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WX48	190 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOB	Q15370	118 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	PGP	A6NDG6	321 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC160	A6NGH7	325 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ASIP	P42127	132 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R45	P59539	299 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	OTOR	Q9NRC9	128 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	LRP2	P98164	4655 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		7	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	KHDC3L	Q587J8	217 aa		7	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		7	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		7	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		7	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0D9SG52	128 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	CRP	P02741	224 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	MT1HL1	P0DM35	61 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZRU5	148 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	NIT1	Q86X76	327 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	MBD2	Q9UBB5	411 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MWV9	139 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM262	E9PQX1	116 aa		6.98	□□□□□ -1.29

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