RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFB3O43676 98 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 PSPNO60542 156 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL11P62913 178 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ERCC8Q13216 396 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1B0GXF2 115 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 HBG2P69892 147 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 MIC13Q5XKP0 118 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.49□□□□□ -1.85
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RABGGTB-213ENST00000496055 C6orf223Q8N319 242 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.49□□□□□ -1.85
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RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.49□□□□□ -1.85
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RABGGTB-213ENST00000496055 CENPWQ5EE01 88 aa3.49□□□□□ -1.85
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF524Q96C55 264 aa3.49□□□□□ -1.85
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RABGGTB-213ENST00000496055 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.49□□□□□ -1.85
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RABGGTB-213ENST00000496055 SSSCA1O60232 199 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 FGF12P61328 243 aa3.48□□□□□ -1.85
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RABGGTB-213ENST00000496055 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.46□□□□□ -1.86
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RABGGTB-213ENST00000496055 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 CXCL5P42830 114 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 CFHR3Q02985 330 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 Q6YL49 198 aa3.46□□□□□ -1.86
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