RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 SIVA1O15304 175 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 SPANXA1Q9NS26 97 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 IGLL1P15814 213 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 LMO4P61968 165 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 J3QQQ9 107 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 C9JAW5 83 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 ATP5G1P05496 136 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 ZNF747Q9BV97 191 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 CGB3P0DN86 165 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 CGB7P0DN87 165 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 ANAPC13Q9BS18 74 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 A0A096LPF7 62 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 ODF3BA8MYP8 253 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 PRSS29PA6NIE9 313 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 INAFM2P0DMQ5 153 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 INSL3P51460 131 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 MORN5Q5VZ52 161 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 SNHG12Q9BXW3 62 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 PKIGQ9Y2B9 76 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 MED14OSP0DP75 135 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 A0A0J9YY99 117 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 C9orf118A6NHY6 69 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 ZFAND6Q6FIF0 208 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 DENND4AQ7Z401 1863 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 H3BMM0 161 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 ZNF124Q15973 351 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 ASPHD1Q5U4P2 390 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 ICOSQ9Y6W8 199 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 K7EQD1 137 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 KMT2EQ8IZD2 1858 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 NXPH4O95158 308 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 MRAPQ8TCY5 172 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 FANCD2OSQ96PS1 177 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-213ENST00000489895 PRO1854Q9UHT4 67 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 P0C879 139 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 SUMO4Q6EEV6 95 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 E7EUB6 86 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 SPINK8P0C7L1 97 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 C11orf1Q9H5F2 150 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 CUL9Q8IWT3 2517 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 CEND1Q8N111 149 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 C19orf84I3L1E1 186 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 SOCS3O14543 225 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 HERV-K104P63124 156 aa13.13□□□□□ -0.31
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NISCH-213ENST00000489895 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 FREM1Q5H8C1 2179 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 TMEM126AQ9H061 195 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 GYPEP15421 78 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 C1orf43Q9BWL3 253 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 CCL18P55774 89 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 OCIAD2Q56VL3 154 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 IGHG4P01861 327 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 XCL1P47992 114 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 C10orf142B7Z368 130 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 GAGE2AQ6NT46 116 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 UBE2WQ96B02 151 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 PLCE1Q9P212 2302 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 PRAC2D3DTV9 90 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 Q8N1Y9 231 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 FGF6P10767 208 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 CLPSL2Q6UWE3 100 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 IGF1P05019 195 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 F8W1H4 67 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 LINC01545Q5VT33 79 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 SPG11Q96JI7 2443 aa13.08□□□□□ -0.31
NISCH-213ENST00000489895 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 Q6YL49 198 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 ZFP2Q6ZN57 461 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 ZNF503Q96F45 646 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-213ENST00000489895 PRSS47A8MTI9 375 aa13.08□□□□□ -0.32
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