RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	CRYGD	P07320	174 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	EVI2A	P22794	236 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	XG	P55808	180 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	RHOH	Q15669	191 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	PEX7	O00628	323 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	CRIP1	P50238	77 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	8.03	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	KRTAP10-1	P60331	282 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	UBE2G2	P60604	165 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	ZFP69	Q49AA0	526 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	PARL	Q9H300	379 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PTPRF-211	ENST00000467464	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		8.02	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	8.02	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	PPT1	P50897	306 aa		8.02	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		8.02	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	JPT2	Q9H910	190 aa		8.02	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464		Q9UF83	564 aa		8.02	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	EREG	O14944	169 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	IFNA7	P01567	189 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	LELP1	Q5T871	98 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	IL36B	Q9NZH7	164 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	HERC1	Q15751	4861 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	SMLR1	H3BR10	107 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	ARPC5	O15511	151 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	ASIP	P42127	132 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	FHIT	P49789	147 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	RGS21	Q2M5E4	152 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464		Q8N3U1	123 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		8	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464		A8MWV9	139 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464		B4DEV8	164 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	SH2D1A	O60880	128 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464		H3BVH4	76 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464		M0R036	132 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	LTA	P01374	205 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-30	P01768	117 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-33	P01772	117 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	FMC1	Q96HJ9	113 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	GAGE12J	A6NER3	117 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	GAGE1	Q13065	139 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	GAGE4	Q13068	117 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	GAGE5	Q13069	117 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	WFDC2	Q14508	124 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF345	Q14585	488 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	LAGE3	Q14657	143 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC01559	Q495D7	138 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		7.96	□□□□□ -1.13
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464		Q9HAA7	133 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	MYCBP2	O75592	4640 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	PAGE4	O60829	102 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	SEC11B	P0C7V7	166 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	GCSH	P23434	173 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464		Q8N814	137 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	SFRP2	Q96HF1	295 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		7.94	□□□□□ -1.14
PTPRF-211	ENST00000467464	EPM2A	B3EWF7	344 aa		7.94	□□□□□ -1.14

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.2 ms