RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A0A0MQY5	61 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1W2PS18	150 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	BUB3	O43684	328 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	DPM2	O94777	84 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPPC	P23582	126 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	RASL10A	Q92737	203 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	METTL26	Q96S19	204 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRGV9	Q99603	122 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	JPT2	Q9H910	190 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		K7EMT4	169 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		K7EP34	96 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	IL4	P05112	153 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLL1	P15814	213 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	INSL3	P51460	131 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	LYZ	P61626	148 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6Q795	121 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6ZRG5	221 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	AQP10	Q96PS8	301 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	RARRES2	Q99969	163 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	AGPAT2	O15120	278 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	CXorf1	O96002	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00869	P0C866	280 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	CXCL2	P19875	107 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	CBLN1	P23435	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF90	Q03938	601 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6ZN92	141 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	HYPM	O75409	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IFITM1	P13164	125 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	FOXI1	Q12951	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	FRZB	Q92765	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	MGST2	Q99735	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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