RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 SIRPDQ9H106 197 aa11.34□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 CDIP1Q9H305 208 aa11.34□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 M0R381 172 aa11.34□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ATP6V0E1O15342 81 aa11.34□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
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TOP3B-206ENST00000436282 C19orf84I3L1E1 186 aa11.34□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 U3KQE9 123 aa11.34□□□□□ -0.59
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TOP3B-206ENST00000436282 UBE2D2P62837 147 aa11.33□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 LYRM7Q5U5X0 104 aa11.33□□□□□ -0.6
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TOP3B-206ENST00000436282 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.33□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.33□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.33□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 C16orf92Q96LL3 132 aa11.33□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.33□□□□□ -0.6
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TOP3B-206ENST00000436282 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.31□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.31□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 IGF1P05019 195 aa11.31□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 S100A4P26447 101 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ASIPP42127 132 aa11.31□□□□□ -0.6
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TOP3B-206ENST00000436282 ZFP2Q6ZN57 461 aa11.31□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa11.31□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV21A0A0B4J279 112 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 G3V318 75 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 MGPP08493 103 aa11.3□□□□□ -0.6
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TOP3B-206ENST00000436282 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01548A6NM66 108 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 J3KRW8 73 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 SPRY2O43597 315 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R17O96001 155 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2E1P51965 193 aa11.3□□□□□ -0.6
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TOP3B-206ENST00000436282 SFTA2Q6UW10 78 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 PPDPFLQ8WWR9 84 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00477Q96M19 166 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ITPR1Q14643 2758 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 MED14OSP0DP75 135 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 C20orf173Q96LM9 149 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 CRYGDP07320 174 aa11.29□□□□□ -0.6
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TOP3B-206ENST00000436282 TEN1Q86WV5 123 aa11.29□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.29□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 HERVK_113P61574 105 aa11.29□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.29□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM219Q86XT9 240 aa11.29□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 GLMPQ8WWB7 406 aa11.29□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0J9YY99 117 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 C11orf86A6NJI1 115 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 MT-ATP8P03928 68 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZUT4 128 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 AJUBAQ96IF1 538 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 PTH2Q96A98 100 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 CARD19Q96LW7 228 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 VCX2Q9H322 139 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00527Q9UJ94 153 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa11.27□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.27□□□□□ -0.6
TOP3B-206ENST00000436282 GPHB5Q86YW7 130 aa11.27□□□□□ -0.6
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TOP3B-206ENST00000436282 XGP55808 180 aa11.27□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.27□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 OVOL1O14753 267 aa11.26□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 NPFFO15130 113 aa11.26□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 Q5PR19 223 aa11.26□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.26□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 TSHBP01222 138 aa11.26□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 PIEZO1Q92508 2521 aa11.26□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 SVIPQ8NHG7 77 aa11.26□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 WFDC12Q8WWY7 111 aa11.26□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 PRORYQ9H606 182 aa11.26□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 PMVKQ15126 192 aa11.25□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 BRD3OSQ6XYD6 125 aa11.25□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.25□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 IGIPA6NJ69 53 aa11.25□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 A8MWV9 139 aa11.25□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-30P01768 117 aa11.25□□□□□ -0.61
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