RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 LINC01546A6NGU7 62 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 G3V4G9 280 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 CD33P20138 364 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZSV7 163 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 MRAP2Q96G30 205 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 RNF185Q96GF1 192 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 C16orf95Q9H693 158 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0J9YX75 114 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 PPP1R17O96001 155 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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POLR1A-204ENST00000424089 PRR9Q5T870 116 aa7.49□□□□□ -1.21
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POLR1A-204ENST00000424089 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 C7orf71A4D174 169 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 CSN3P07498 182 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 PSMG4Q5JS54 123 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 OR11H1Q8NG94 326 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 C14orf144Q96I85 54 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 F6UB75 175 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 H3BVH4 76 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 NXPH4O95158 308 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 TNFRSF6BO95407 300 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 NPYP01303 97 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 HBDP02042 147 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 SSTP61278 116 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 MUC21Q5SSG8 566 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 K7EMI3 77 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 M0R381 172 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF688P0C7X2 276 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 EDN2P20800 178 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 EVI2AP22794 236 aa7.46□□□□□ -1.22
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POLR1A-204ENST00000424089 SPATA45Q537H7 98 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 Q8N8P6 123 aa7.46□□□□□ -1.22
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POLR1A-204ENST00000424089 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 A8MTW9 85 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 J3KRW8 73 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 TFPI2P48307 235 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 SLURP1P55000 103 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 LINC01545Q5VT33 79 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 AP1S3Q96PC3 154 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 C20orf78Q9BR46 151 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 OR4C46A6NHA9 309 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.44□□□□□ -1.22
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POLR1A-204ENST00000424089 FCER1GP30273 86 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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POLR1A-204ENST00000424089 FHL3Q13643 280 aa7.44□□□□□ -1.22
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POLR1A-204ENST00000424089 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 ST20Q9HBF5 79 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 LINC01549A6NIU2 74 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 SMKR1H3BMG3 65 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 M0R143 59 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 GNRH2O43555 120 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 NCR2O95944 276 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 SMIM17P0DL12 118 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 IGLC3P0DOY3 106 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 HLA-DRB4P13762 266 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1A-204ENST00000424089 G0S2P27469 103 aa7.43□□□□□ -1.22
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