RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 GP1BBP13224 206 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB110Q30KQ9 67 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00643Q86TS7 51 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 RITA1Q96K30 269 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNA1EQ15878 2313 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF137PP52743 207 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8N8P6 123 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 ESM1Q9NQ30 184 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 PKDREJQ9NTG1 2253 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1-39P01597 117 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1D-39P04432 117 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 HBBP68871 147 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 NRACQ8N912 160 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 VN1R4Q7Z5H5 301 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 MKXQ8IYA7 352 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 NUP37Q8NFH4 326 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 Q96M66 194 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 SRXN1Q9BYN0 137 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 OSTCQ9NRP0 149 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 ZZEF1O43149 2961 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL14EPLP0DKL9 152 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF12P61328 243 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 PIGYQ3MUY2 71 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL17Q92583 94 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 CXCL5P42830 114 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 M0R381 172 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 SH2D1AO60880 128 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV4-39P01824 125 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 LST1O00453 97 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 TFF1P04155 84 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV4-34P06331 123 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS2P07478 247 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 LYZL4Q96KX0 146 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01600Q96MT4 127 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 C9JCJ5 164 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1-5P01602 117 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 XCL1P47992 114 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 XCL2Q9UBD3 114 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PNR3 127 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 HIGD1CA8MV81 97 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV2-8P01709 118 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 COX5AP20674 150 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 PIEZO1Q92508 2521 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 EDDM3BP56851 147 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 LAGE3Q14657 143 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 C2orf82Q6UX34 121 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF22Q9HCT0 170 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNA1HO95180 2353 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 WNT9BO14905 357 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 NBASA2RRP1 2371 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1D-12P01611 117 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 SPINK9Q5DT21 86 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 H7C2G1 150 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00313P59037 77 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 USF3Q68DE3 2245 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 H7C423 109 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 CFC1BP0CG36 223 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 CFC1P0CG37 223 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.5 ms