RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXD11-201ENST00000249504 MT-ND6P03923 174 aa14.02□□□□□ -0.16
HOXD11-201ENST00000249504 TRGC2P03986 189 aa14.02□□□□□ -0.16
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HOXD11-201ENST00000249504 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.02□□□□□ -0.16
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HOXD11-201ENST00000249504 C11orf45Q8TAV5 145 aa13.93□□□□□ -0.18
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HOXD11-201ENST00000249504 HIST1H2BJP06899 126 aa13.92□□□□□ -0.18
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HOXD11-201ENST00000249504 HIST1H2BBP33778 126 aa13.92□□□□□ -0.18
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HOXD11-201ENST00000249504 HIST1H2BMQ99879 126 aa13.92□□□□□ -0.18
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HOXD11-201ENST00000249504 SPXQ9BT56 116 aa13.91□□□□□ -0.18
HOXD11-201ENST00000249504 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
HOXD11-201ENST00000249504 CELA1Q9UNI1 258 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXD11-201ENST00000249504 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.9□□□□□ -0.19
HOXD11-201ENST00000249504 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.9□□□□□ -0.19
HOXD11-201ENST00000249504 TWIST1Q15672 202 aa13.9□□□□□ -0.19
HOXD11-201ENST00000249504 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.19
HOXD11-201ENST00000249504 NTF3P20783 257 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXD11-201ENST00000249504 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
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