RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MyadmO35682 320 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01804 111 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxl7Q5BJ29 491 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pafah1b2Q61206 229 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hapln4Q80WM4 400 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nrn1Q8CFV4 142 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alkbh6Q8K2U2 238 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Etfrf1Q91V16 86 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eaf1Q9D4C5 268 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnip2Q9JJ69 270 aa5.45□□□□□ -1.54
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav6n-5A0A075B621 112 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav12d-3A0A075B6A4 115 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav6-5A0A075B6B5 112 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm28171A0A087WQ19 227 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv1-132A0A0B4J1H9 120 aa5.45□□□□□ -1.54
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1116E9PXB8 307 aa5.45□□□□□ -1.54
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm6665F6Y363 85 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r158G3UY92 307 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 3110021N24RikJ3QMN2 152 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21882J3QN86 361 aa5.45□□□□□ -1.54
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hoxa3P02831 443 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd59bP58019 129 aa5.45□□□□□ -1.54
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Siah2Q06986 325 aa5.45□□□□□ -1.54
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oraov1Q8CH62 137 aa5.45□□□□□ -1.54
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 TslpQ9JIE6 140 aa5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lsm4Q9QXA5 137 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RelnQ60841 3461 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv6-23A0A140T8N5 115 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1293-psA0A1L1SVB5 326 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp980A2A9J5 645 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H2al1jA2BFR3 109 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem139E9PX92 214 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm9964E9Q9S5 144 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Colca2F8VPY8 239 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr15P23275 312 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col8a2P25318 699 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gabra2P26048 451 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gnb4P29387 340 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RhobP62746 196 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RanP62827 216 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cib3Q0P523 160 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cnep1r1Q3UJ81 125 aa5.44□□□□□ -1.54
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr513Q8VFZ3 309 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rer1Q9CQU3 196 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mlst8Q9DCJ1 326 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P2ry6Q9ERK9 328 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trbv3A0A0A6YYE2 117 aa5.44□□□□□ -1.54
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hoxb2P0C1T1 354 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defa-rs1P17533 116 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smim9Q3V0X1 137 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prdx2Q61171 198 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf329Q6GQR8 522 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vma21Q78T54 101 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10309Q8C648 119 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vstm2aQ8R0A6 236 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GmppaQ922H4 420 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nus1Q99LJ8 297 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr87Q99MT7 358 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H2afb1Q9CQ70 111 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lamtor5Q9D1L9 91 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa5.44□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav17A0A075B655 113 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv1-131A0A140T8M8 120 aa5.43□□□□□ -1.54
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hsbp1l1B2RXB2 72 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp976E9Q981 636 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf212F6TQD1 307 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gata2O09100 480 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ascl2O35885 263 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lgals3P16110 264 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SriQ6P069 198 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp420Q7TMN8 578 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr963Q7TRA9 311 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5148Q8BGG2 154 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700001C19RikQ8K168 210 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rhbdd2Q8VEK2 361 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znrf1Q91V17 227 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf125Q9D9R0 233 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r171Q9EPS6 316 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccl28Q9JIL2 130 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arfgef3Q3UGY8 2170 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Shank1D3YZU1 2167 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dmxl2Q8BPN8 3032 aa5.43□□□□□ -1.54
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv1-19A0A0A6YWX0 117 aa5.43□□□□□ -1.54
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