RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 ADIRFQ15847 76 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 FRZBQ92765 325 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 TVP23CQ96ET8 276 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 APLNQ9ULZ1 77 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 J3KRW8 73 aa8.37□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 M0R036 132 aa8.37□□□□□ -1.07
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CAPNS1-209ENST00000590049 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.37□□□□□ -1.07
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CAPNS1-209ENST00000590049 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.36□□□□□ -1.07
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CAPNS1-209ENST00000590049 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.35□□□□□ -1.07
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CAPNS1-209ENST00000590049 GCGP01275 180 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 CRISP2P16562 243 aa8.35□□□□□ -1.07
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CAPNS1-209ENST00000590049 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 C7orf71A4D174 169 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 A8MTW9 85 aa8.34□□□□□ -1.07
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CAPNS1-209ENST00000590049 INSP01308 110 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-209ENST00000590049 ERVFC1-1P60608 527 aa8.34□□□□□ -1.07
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CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.33□□□□□ -1.08
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CAPNS1-209ENST00000590049 P01737 135 aa8.33□□□□□ -1.08
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CAPNS1-209ENST00000590049 MLST8Q9BVC4 326 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 XKRY2A2RUG3 117 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 KLLNB2CW77 178 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 IGLL5B9A064 214 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 PPP1R2P9O14990 202 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 IGLV2-8P01709 118 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 BTN1A1Q13410 526 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.32□□□□□ -1.08
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CAPNS1-209ENST00000590049 SFRP2Q96HF1 295 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 XCL2Q9UBD3 114 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 NAGKQ9UJ70 344 aa8.32□□□□□ -1.08
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CAPNS1-209ENST00000590049 K7EN84 100 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 UBE2CO00762 179 aa8.31□□□□□ -1.08
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CAPNS1-209ENST00000590049 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6AWC8 147 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 OSTCQ9NRP0 149 aa8.31□□□□□ -1.08
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