RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587465.6

TNNT1-208, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT1, Length 1,065 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNT1-208	ENST00000587465	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TNNT1-208	ENST00000587465	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TNNT1-208	ENST00000587465	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TNNT1-208	ENST00000587465	SPX	Q9BT56	116 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TNNT1-208	ENST00000587465	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TNNT1-208	ENST00000587465	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	SLA	Q13239	276 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465		M0R2P5	195 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	GGTLC3	B5MD39	225 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	IGLV2-11	P01706	119 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	STAG3L2	P0CL84	134 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	STAG3L3	P0CL85	134 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465		A0A087WTM6	91 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465		C9JCJ5	164 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	TCRA	P04437	139 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	GCHFR	P30047	84 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	KRTAP10-1	P60331	282 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	ERVFC1-1	P60608	527 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	XG	P55808	180 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	FAT1	Q14517	4588 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	AQP10	Q96PS8	301 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	PSG8	Q9UQ74	426 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TNNT1-208	ENST00000587465	GCG	P01275	180 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	ORM1	P02763	201 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	LINC00479	Q96M42	142 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	HAMP	P81172	84 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	PRNT	Q86SH4	94 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	C9orf85	Q96MD7	179 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	RS1	O15537	224 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	CRYGD	P07320	174 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	ZNF876P	Q49A33	203 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465		Q6ZSN1	163 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465		Q8N3U1	123 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	MED28	Q9H204	178 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	KCNS1	Q96KK3	526 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	EPDR1	Q9UM22	224 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	EVI2A	P22794	236 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	PPT1	P50897	306 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	NFE4	Q86UQ8	179 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465		Q9UF83	564 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465		G3V3Q6	166 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	PTTG1	O95997	202 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TNNT1-208	ENST00000587465	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	UBE2G2	P60604	165 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	JPT2	Q9H910	190 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	EREG	O14944	169 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	CXorf1	O96002	111 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	IGHV3-30	P01768	117 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	IGHV3-33	P01772	117 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	SMUG1	Q53HV7	270 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465		Q9HAA7	133 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		13	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	TAAR5	O14804	337 aa		13	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
TNNT1-208	ENST00000587465	SERF2	P84101	59 aa		13	□□□□□ -0.33

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