RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CR1LQ2VPA4 569 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf53Q8IXP5 236 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 SHISA9B4DS77 424 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 FOXE3Q13461 319 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 F6UB75 175 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 J3QLI3 93 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 C8orf31Q8N9H6 132 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 DOCK9Q9BZ29 2069 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 A0A096LPF7 62 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 BAALC-AS2P0C853 105 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 DOCK11Q5JSL3 2073 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 C5orf47Q569G3 176 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 PRSS29PA6NIE9 313 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 FOXI2Q6ZQN5 318 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 Q8NFD4 153 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 CTSZQ9UBR2 303 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 MGAMO43451 1857 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 TDRG1Q3Y452 100 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRM-211ENST00000580170 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 C22orf46C9J442 243 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 APOC4P55056 127 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2G2CQ5R387 149 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 SPRNQ5BIV9 151 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 RBAKDNA6NC62 111 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 PI4KAP42356 2102 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF493Q6ZR52 646 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 HEATR5AQ86XA9 2040 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 H3BUA1 57 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 CLPSL2Q6UWE3 100 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 NUPR1O60356 82 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 NBL1P41271 181 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 ELANEP08246 267 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 ATOX1O00244 68 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 WFDC2Q14508 124 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 ANGP03950 147 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 IGFBPL1Q8WX77 278 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 RHOHQ15669 191 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 SPRY2O43597 315 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 TEN1Q86WV5 123 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GX51 115 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 hADV29S1A0JD25 119 aa16.71■□□□□ 0.27
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PTPRM-211ENST00000580170 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRM-211ENST00000580170 U3KQE9 123 aa16.71■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 K7EMI3 77 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa16.7■□□□□ 0.26
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PTPRM-211ENST00000580170 G3V4G9 280 aa16.7■□□□□ 0.26
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PTPRM-211ENST00000580170 ORMDL1Q9P0S3 153 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 PRB1P04280 392 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 IGHG2P01859 326 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 GP9P14770 177 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 PRSS33Q8NF86 280 aa16.69■□□□□ 0.26
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PTPRM-211ENST00000580170 A0A0B4J2C4 111 aa16.69■□□□□ 0.26
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PTPRM-211ENST00000580170 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
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PTPRM-211ENST00000580170 LINC01545Q5VT33 79 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00173Q6ZV60 143 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 FOXI1Q12951 378 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 XCL1P47992 114 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 I3L2K1 104 aa16.68■□□□□ 0.26
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PTPRM-211ENST00000580170 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
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PTPRM-211ENST00000580170 IGHV4-59P01825 116 aa16.67■□□□□ 0.26
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PTPRM-211ENST00000580170 POLEQ07864 2286 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 GRNP28799 593 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 Q71RC1 249 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 NPBQ8NG41 125 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 FXYD2P54710 66 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 DOCK8Q8NF50 2099 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0J9YY99 117 aa16.64■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 VPREB3Q9UKI3 123 aa16.64■□□□□ 0.26
PTPRM-211ENST00000580170 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 PATE2Q6UY27 113 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A29Q8N8R3 303 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 RMI2Q96E14 147 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 DEFB136Q30KP8 78 aa16.63■□□□□ 0.25
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