RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 Q86TA4 180 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 BAGE2Q86Y30 109 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 OCC1Q8TAD7 63 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 DCANP1Q8TF63 244 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 IMMP2LQ96T52 175 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 K7EN84 100 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 C6orf223Q8N319 242 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 SFRP2Q96HF1 295 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 FAM210BQ96KR6 192 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 C16orf92Q96LL3 132 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00479Q96M42 142 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 OSTCQ9NRP0 149 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF492Q9P255 531 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.63□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 K7EQG2 157 aa6.63□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 ID1P41134 155 aa6.63□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 RAB5BP61020 215 aa6.63□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.63□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.63□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 YPEL4Q96NS1 127 aa6.63□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 PSG8Q9UQ74 426 aa6.63□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 X6R8D5 127 aa6.63□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.62□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.62□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.62□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 H7BYZ3 331 aa6.62□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.62□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 HTN3P15516 51 aa6.62□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 S100PP25815 95 aa6.62□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 CT83Q5H943 113 aa6.62□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00477Q96M19 166 aa6.62□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 C18orf15Q96N68 181 aa6.62□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.62□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 EMP1P54849 157 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 FRZBQ92765 325 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.61□□□□□ -1.35
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SMAD3-215ENST00000560424 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.6□□□□□ -1.35
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SMAD3-215ENST00000560424 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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SMAD3-215ENST00000560424 J3QL48 77 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF138P52744 262 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 ERVFC1-1P60608 527 aa6.6□□□□□ -1.35
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SMAD3-215ENST00000560424 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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SMAD3-215ENST00000560424 PRNTQ86SH4 94 aa6.6□□□□□ -1.35
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SMAD3-215ENST00000560424 C20orf173Q96LM9 149 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 ODF3Q96PU9 254 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 V9GYV3 84 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM189A5PLL7 270 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 A8MTW9 85 aa6.59□□□□□ -1.35
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SMAD3-215ENST00000560424 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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SMAD3-215ENST00000560424 ELOBQ15370 118 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF738Q8NE65 137 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 NUDT11Q96G61 164 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 VGLL1Q99990 258 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 IL36BQ9NZH7 164 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 NACAE9PAV3 2078 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 AGRNO00468 2067 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-215ENST00000560424 KNCNA6PVL3 124 aa6.58□□□□□ -1.36
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