RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551430.6

CS-226, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-226ENST00000551430 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.47□□□□□ -0.09
CS-226ENST00000551430 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.47□□□□□ -0.09
CS-226ENST00000551430 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-226ENST00000551430 CCL18P55774 89 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-226ENST00000551430 PRNTQ86SH4 94 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-226ENST00000551430 A0A096LPF7 62 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 K7EQM0 130 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 BCL2L11O43521 198 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 FHL2Q14192 279 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 ESRGQ1W209 222 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 RASL10AQ92737 203 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 A0A0D9SG52 128 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 GCGP01275 180 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 SFTA3P0C7M3 94 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 SPXQ9BT56 116 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 A0A1B0GVY2 172 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 PEX7O00628 323 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 IFNA7P01567 189 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 ZNF479Q96JC4 524 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 HERC2O95714 4834 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 SEC11BP0C7V7 166 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 PAX4O43316 350 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 CRYBA4P53673 196 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 SMUG1Q53HV7 270 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 TMUB2Q71RG4 321 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 Q86TA4 180 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 M0R2P5 195 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 KCNS1Q96KK3 526 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 PRO0255Q9UI72 69 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 KIAA1109Q2LD37 5005 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-226ENST00000551430 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 UPK3BQ9BT76 320 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 A0A1B0GV50 99 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 UMAD1C9J7I0 102 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 Q6ZNX1 250 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 Q9H8V8 135 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 ZFP69Q49AA0 526 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 STOML3Q8TAV4 291 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 C9orf85Q96MD7 179 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 PAGE4O60829 102 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 CRIP1P50238 77 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 PPT1P50897 306 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 SLAQ13239 276 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 CST9LP1Q5W188 147 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 PFDN1O60925 122 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 OR4C5Q8NGB2 326 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-226ENST00000551430 C9JCJ5 164 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 K7EQD1 137 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 ZNF876PQ49A33 203 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 GYPEP15421 78 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 ZNF575Q86XF7 245 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 C6orf223Q8N319 242 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 FMC1Q96HJ9 113 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 RS1O15537 224 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 SH2D1AO60880 128 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 LTAP01374 205 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 CCL20P78556 96 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-226ENST00000551430 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms