RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529404.5

FADS3-208, Transcript of fatty acid desaturase 3, human

TSL 2

Gene FADS3, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS3-208	ENST00000529404	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404	GATA3	P23771	443 aa		11.48	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404	VPS13C	Q709C8	3753 aa		11.48	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		11.48	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		11.48	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404		H3BVH4	76 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404	TM4SF20	Q53R12	229 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404	ZMAT4	Q9H898	229 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FADS3-208	ENST00000529404		K7EMT4	169 aa		11.46	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	TAX1BP3	O14907	124 aa		11.46	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	DEFB1	P60022	68 aa		11.46	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		11.46	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	DKK2	Q9UBU2	259 aa		11.46	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	SMPX	Q9UHP9	88 aa		11.46	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		11.46	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	SLC25A16	P16260	332 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	MRAP2	Q96G30	205 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	C18orf15	Q96N68	181 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	MED14OS	P0DP75	135 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	CST9L	Q9H4G1	147 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404		K7ERU9	68 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	ODF1	Q14990	250 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404		A0A096LNT2	108 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404		J3KRW8	73 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	NRGN	Q92686	78 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404		F6UB75	175 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	CD5L	O43866	347 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	PSMB8	P28062	276 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	PSMG4	Q5JS54	123 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	CACNA1A	O00555	2505 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	SIVA1	O15304	175 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	ASIP	P42127	132 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	LAGE3	Q14657	143 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV4-59	P01825	116 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM89	A2RUT3	159 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	ATP5L	O75964	103 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	SMIM17	P0DL12	118 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	SCGB2A2	Q13296	93 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	PIEZO1	Q92508	2521 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	EDN2	P20800	178 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404		J3QLI3	93 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	PRSS1	P07477	247 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	11.4	□□□□□ -0.58	1e-9	■□□□□ 9
FADS3-208	ENST00000529404	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	DCANP1	Q8TF63	244 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	SEC11A	P67812	179 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FADS3-208	ENST00000529404	KLLN	B2CW77	178 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404		M0R381	172 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	ID1	P41134	155 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	FOXC2	Q99958	501 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404		A1L4Q6	167 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	GNRH2	O43555	120 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	SPRY2	O43597	315 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	IGKC	P01834	107 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	PCP2	Q8IVA1	136 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	RASL10A	Q92737	203 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	COL12A1	Q99715	3063 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	NXPH4	O95158	308 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	SRD5A1	P18405	259 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	C20orf78	Q9BR46	151 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	NMU	P48645	174 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	TCTA	P57738	103 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	HSD52	Q0P140	79 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404		A0A1B0GV72	72 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	DPM2	O94777	84 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59

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