RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CXorf1O96002 111 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LYPD5Q6UWN5 251 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEGR1Q7Z3B1 354 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNS1Q96KK3 526 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SDF2L1Q9HCN8 221 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNFSF18Q9UNG2 199 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 M0R2P5 195 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCRAP04437 139 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TYMSP04818 313 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR4C5Q8NGB2 326 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUN5Q8TC36 379 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM167BQ9NRX6 74 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BTF3P20290 206 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRIP30626 198 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV4A0A0B4J268 109 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GYPEP15421 78 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSG8Q9UQ74 426 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF222A6NCQ9 220 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 K7EQD1 137 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ORM1P02763 201 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC00315P59091 139 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATA12Q7Z6I5 190 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR2T35Q8NGX2 323 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EPDR1Q9UM22 224 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRNTQ86SH4 94 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GGTLC3B5MD39 225 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAAR5O14804 337 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GCGP01275 180 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZFP69Q49AA0 526 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C9JCJ5 164 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMUG1Q53HV7 270 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TXNDC17Q9BRA2 123 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGLV2-11P01706 119 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGS21Q2M5E4 152 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C11orf21Q9P2W6 132 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCLOQ9Y6V0 5065 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1W2PRE2 83 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PFN1P07737 140 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF876PQ49A33 203 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM75Q8N9X5 138 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LY96Q9Y6Y9 160 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFNA7P01567 189 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF726P1Q15940 193 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBE2G2P60604 165 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NHLRC2Q8NBF2 726 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV34A0A0B4J273 112 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WFDC10BQ8IUB3 73 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC00479Q96M42 142 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARPC5O15511 151 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDK2AP2O75956 126 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EVI2AP22794 236 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPT1P50897 306 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP10-2P60368 255 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH2D6Q7Z4S9 175 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NFE4Q86UQ8 179 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 G3V3Q6 166 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RS1O15537 224 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFAP126Q5VTH2 177 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C9orf85Q96MD7 179 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RYR1P21817 5038 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PGPEP1LA6NFU8 196 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PEX7O00628 323 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EREGO14944 169 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CIDEAO60543 219 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DPPA3Q6W0C5 159 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC25A29Q8N8R3 303 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRADC1Q9BSG0 188 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM74A7A6NL05 159 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FABP5P3A8MUU1 101 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 K7EP13 123 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 S100A4P26447 101 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERVFC1-1P60608 527 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF506Q5JVG8 444 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYTL1Q9NRR1 136 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MSRB1Q9NZV6 116 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAH10OSP0CZ25 163 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTH2Q96A98 100 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms