RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf170	A2RU37	121 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	RS1	O15537	224 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF138	P52744	262 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R30	P59541	319 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL16	Q0P5N6	197 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE6H	Q13956	83 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF846	Q147U1	533 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TDRG1	Q3Y452	100 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01620	Q4KN68	170 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8TAT8	98 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	RASL10A	Q92737	203 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF492	Q9P255	531 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	NAGK	Q9UJ70	344 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFB4	O95168	129 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	PYY	P10082	97 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	CAV2	P51636	162 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	BAX	Q07812	192 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	WFDC2	Q14508	124 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	C7orf66	A4D0T2	115 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	CSN1S1	P47710	185 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	LAGE3	Q14657	143 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	BAK1	Q16611	211 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R2P5	195 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	CST7	O76096	145 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV2-8	P01709	118 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	INPP1	P49441	399 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	ASAH1	Q13510	395 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	LELP1	Q5T871	98 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM63	Q969Q1	353 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf51	A6NDU8	294 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF266	Q14584	549 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOH	Q15669	191 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	BAALC	Q8WXS3	180 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5S	Q99766	215 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM18	P0DKX4	95 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF7	P21781	194 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N976	141 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	RMI2	Q96E14	147 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM25E	A8MYX2	175 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	GGTLC3	B5MD39	225 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	VWC2	Q2TAL6	325 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51M1	Q9H341	326 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF213	Q63HN8	5207 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	GNRH2	O43555	120 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFB6	O95139	128 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10J4	P0C629	311 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A5	P33763	92 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	HBG1	P69891	147 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	HBG2	P69892	147 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6AWC8	147 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	STX12	Q86Y82	276 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	PAXX	Q9BUH6	204 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		7.08	□□□□□ -1.28

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