RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 FAM222AQ5U5X8 452 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ZNF493Q6ZR52 646 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 OR8I2Q8N0Y5 310 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ZNF709Q8N972 641 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 BPIFCQ8NFQ6 507 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 OR4C16Q8NGL9 310 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 OR13C8Q8NGS7 320 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 OR10J6PQ8NGY7 276 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 OR1S1Q8NH92 325 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 GLYATL2Q8WU03 294 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 SMIM4Q8WVI0 70 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ACY3Q96HD9 319 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 TRGV9Q99603 122 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 BCL7BQ9BQE9 202 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 DOK5Q9P104 306 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 XCL2Q9UBD3 114 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 EXTL2Q9UBQ6 330 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.45□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 A0A0J9YX75 114 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 C16orf90A8MZG2 172 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ANKRD65E5RJM6 399 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 FNDC10F2Z333 226 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 H3BNG1 76 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 K7EP13 123 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 HPGDSO60760 199 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 RPL7P18124 248 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 TAS2R60P59551 318 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 SPINK9Q5DT21 86 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 NEGR1Q7Z3B1 354 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 OR4B1Q8NGF8 309 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 LINC00052Q96N35 136 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 PBDC1Q9BVG4 233 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 TMEM147Q9BVK8 224 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.44□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 RYR1P21817 5038 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 PCP4L1A6NKN8 68 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 H7BYZ3 331 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 K7EQM0 130 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 RGS5O15539 181 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 HTN3P15516 51 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 EMP1P54849 157 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 PLP1P60201 277 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 VBP1P61758 197 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 NCS1P62166 190 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 LSM3P62310 102 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 AKR1C1Q04828 323 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 IL18Q14116 193 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 CLINT1Q14677 625 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 SP6Q3SY56 376 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 TMEM128Q5BJH2 165 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 FAM78BQ5VT40 261 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 KCNIP4Q6PIL6 250 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 LCN15Q6UWW0 184 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 OR2G3Q8NGZ4 309 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 RAB2BQ8WUD1 216 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 GPR146Q96CH1 333 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ODF3Q96PU9 254 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 SLC50A1Q9BRV3 221 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 UPK3BQ9BT76 320 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.43□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 DNAH2Q9P225 4427 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 C7orf66A4D0T2 115 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ZNF98A6NK75 572 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 F5H768 121 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 K7EPK0 472 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 M0R2N4 97 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 WRBO00258 174 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 SYNGR2O43760 224 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 PITX3O75364 302 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 HYPMO75409 117 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 M6PRP20645 277 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 CDKN1BP46527 198 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ZNF90Q03938 601 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 RAB31Q13636 194 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 GUK1Q16774 197 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 GDF5OSQ5U4N7 250 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ZNF767PQ75MW2 155 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 TMEM144Q7Z5S9 345 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ZNF546Q86UE3 836 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 C1orf158Q8N1D5 194 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ZNF738Q8NE65 137 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ZNF680Q8NEM1 530 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 OR11H7Q8NGC8 314 aa2.42□□□□□ -2.02
RBM39-241ENST00000496183 ZNRF2Q8NHG8 242 aa2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 313.6 ms