RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 PYYP10082 97 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 GLRXP35754 106 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 LEPP41159 167 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 HERVK_113P61574 105 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 HERVK_113P63121 156 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 FAM27E3Q08E93 113 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 MLANAQ16655 118 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 ALKBH6Q3KRA9 238 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 LINC00643Q86TS7 51 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 UBE2WQ96B02 151 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 IMMP1LQ96LU5 166 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 FOXC2Q99958 501 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa5.56□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 ATOX1O00244 68 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 OVOL1O14753 267 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 IGLC6P0CF74 106 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 CD24P25063 80 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 CNTFRP26992 372 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 LAGE3Q14657 143 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZSN1 163 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 DEFB126Q9BYW3 111 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 LINC00574Q9H8X3 128 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 BSNQ9UPA5 3926 aa5.55□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 COX6B1P14854 86 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 GNG5P63218 68 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 Q0VFX4 171 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 LINC01620Q4KN68 170 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 CALYQ9NYX4 217 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 GNG12Q9UBI6 72 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 PRO0628Q9UI54 55 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 FRYQ5TBA9 3013 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 PKD1L2Q7Z442 2459 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 RTTNQ86VV8 2226 aa5.54□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 CACNA1BQ00975 2339 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 PPP1R17O96001 155 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 CFC1BP0CG36 223 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 CFC1P0CG37 223 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 CGB3P0DN86 165 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 CGB7P0DN87 165 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 MED14OSP0DP75 135 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 MORN5Q5VZ52 161 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 SRXN1Q9BYN0 137 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 PRORYQ9H606 182 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 USP24Q9UPU5 2620 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.53□□□□□ -1.52
PKP4-211ENST00000481115 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 TRAV17A0A0B4J275 112 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 A0A0J9YX75 114 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 H3BVH4 76 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 PLAUP00749 431 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-30P01768 117 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-33P01772 117 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 TRACP01848 142 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 COX6CP09669 75 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 DEFB109BQ30KR1 87 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 FAM201AQ5SY85 155 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 PRNTQ86SH4 94 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 C5orf38Q86SI9 138 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 GGNQ86UU5 652 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
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